44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1258 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1258  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5181  hypothetical protein  51.08 
 
 		 339 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3111  hypothetical protein  48.13 
 
 		 339 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2904  lytic transglycosylase, catalytic  49.51 
 
 		 276 aa  169  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2688  hypothetical protein  46.03 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3869  hypothetical protein  49.21 
 
 		 346 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.649147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2186  hypothetical protein  50.81 
 
 		 377 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.0774004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3574  hypothetical protein  46.58 
 
 		 290 aa  162  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1331  hypothetical protein  46.49 
 
 		 314 aa  162  9e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0638  hypothetical protein  43.88 
 
 		 638 aa  159  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7204  hypothetical protein  46.52 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2585  hypothetical protein  46.32 
 
 		 372 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2310  hypothetical protein  46.32 
 
 		 372 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0151599 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3244  hypothetical protein  47.12 
 
 		 364 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.262677  normal  0.336955 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0268  hypothetical protein  46.45 
 
 		 360 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1659  hypothetical protein  45.7 
 
 		 324 aa  152  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1844  hypothetical protein  43.98 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2267  hypothetical protein  44.5 
 
 		 370 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2678  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 372 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2905  Lytic transglycosylase catalytic  39.5 
 
 		 372 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3599  lytic transglycosylase catalytic  40.74 
 
 		 406 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515044 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2800  Lytic transglycosylase catalytic  39 
 
 		 371 aa  132  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6296  hypothetical protein  45.7 
 
 		 343 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2720  hypothetical protein  40.98 
 
 		 361 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758469  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4453  hypothetical protein  37.44 
 
 		 360 aa  125  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.01877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2292  lytic transglycosylase catalytic  38.81 
 
 		 387 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238503  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5198  hypothetical protein  36.92 
 
 		 357 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0902474  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2556  hypothetical protein  38.12 
 
 		 381 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2779  hypothetical protein  38.12 
 
 		 381 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2487  hypothetical protein  38.71 
 
 		 377 aa  116  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.867123  normal  0.0497364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0316  Lytic transglycosylase catalytic  38.99 
 
 		 372 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0454669  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5606  hypothetical protein  41.76 
 
 		 388 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3051  hypothetical protein  39.55 
 
 		 435 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4086  Transglycosylase domain protein  29.32 
 
 		 1364 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  34 
 
 		 1096 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  33.09 
 
 		 871 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5677  hypothetical protein  32.65 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3764  hypothetical protein  35.77 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0811492  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  31.65 
 
 		 783 aa  50.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3074  hypothetical protein  34.88 
 
 		 237 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  29.07 
 
 		 1190 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  28.19 
 
 		 1192 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1153  hypothetical protein  29.27 
 
 		 671 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2447  hypothetical protein  34.15 
 
 		 718 aa  42.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197244  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>