31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1153 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1153  hypothetical protein  100 
 
 
671 aa  1327    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3074  hypothetical protein  46.9 
 
 
237 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  38.34 
 
 
783 aa  117  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5677  hypothetical protein  45.14 
 
 
255 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  43.05 
 
 
1190 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  41.72 
 
 
1192 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  44.22 
 
 
871 aa  107  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  41.26 
 
 
1096 aa  104  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  38.93 
 
 
1203 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  38.26 
 
 
1248 aa  93.6  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  37.09 
 
 
1353 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  36.67 
 
 
1263 aa  92  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3764  hypothetical protein  35 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0811492  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4086  Transglycosylase domain protein  32.89 
 
 
1364 aa  68.2  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2447  hypothetical protein  31.48 
 
 
718 aa  64.7  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197244  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0236  hypothetical protein  26.39 
 
 
559 aa  60.8  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2688  hypothetical protein  31.94 
 
 
332 aa  59.3  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3599  lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 
406 aa  54.7  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000515044 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5181  hypothetical protein  31.76 
 
 
339 aa  53.5  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  32.98 
 
 
1032 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  28.06 
 
 
1032 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1844  hypothetical protein  33.77 
 
 
291 aa  49.7  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2678  lytic transglycosylase catalytic  27.15 
 
 
372 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2904  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 
276 aa  48.1  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4093  hypothetical protein  26.89 
 
 
497 aa  47.8  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2905  Lytic transglycosylase catalytic  27.89 
 
 
372 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2800  Lytic transglycosylase catalytic  27.04 
 
 
371 aa  47  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2186  hypothetical protein  29.37 
 
 
377 aa  44.3  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.0774004 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1331  hypothetical protein  27.88 
 
 
314 aa  44.3  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3869  hypothetical protein  28.46 
 
 
346 aa  43.9  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.649147  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1258  hypothetical protein  29.27 
 
 
289 aa  43.9  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.364343 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>