18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2447 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2447  hypothetical protein  100 
 
 
718 aa  1439    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197244  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3074  hypothetical protein  44.62 
 
 
237 aa  84  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5677  hypothetical protein  36.25 
 
 
255 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  35.66 
 
 
1096 aa  75.5  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  34.59 
 
 
783 aa  72  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  35.42 
 
 
871 aa  68.9  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1153  hypothetical protein  33.59 
 
 
671 aa  65.1  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0638  hypothetical protein  48.72 
 
 
638 aa  61.6  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3764  hypothetical protein  35.96 
 
 
274 aa  55.5  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0811492  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  35.79 
 
 
1032 aa  54.7  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5181  hypothetical protein  31.82 
 
 
339 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  34.74 
 
 
1032 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  33.87 
 
 
1203 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  35.56 
 
 
1190 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  34.44 
 
 
1192 aa  48.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5700  hypothetical protein  42.19 
 
 
457 aa  47.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  32.79 
 
 
1248 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1659  hypothetical protein  27.85 
 
 
324 aa  45.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>