39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5700 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5700  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  907    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  53.4 
 
 		 1032 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  53.39 
 
 		 1032 aa  329  7e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  34.62 
 
 		 1190 aa  180  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  30.26 
 
 		 1248 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  33.71 
 
 		 1096 aa  137  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1203 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  30.94 
 
 		 1263 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  30.69 
 
 		 1353 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  29.39 
 
 		 1192 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  37.46 
 
 		 1160 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  44.37 
 
 		 794 aa  97.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  43.7 
 
 		 915 aa  85.5  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0873  Methyl-accepting chemotaxis protein  35.43 
 
 		 701 aa  84  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  32.16 
 
 		 921 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4241  hypothetical protein  41.67 
 
 		 139 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1587  Lytic transglycosylase catalytic  34.62 
 
 		 1285 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1231  hypothetical protein  54.39 
 
 		 647 aa  73.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0293  hypothetical protein  33.9 
 
 		 1164 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2351  hypothetical protein  34.71 
 
 		 669 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  37.5 
 
 		 914 aa  60.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0372  hypothetical protein  29.03 
 
 		 968 aa  60.5  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  32.35 
 
 		 908 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2989  hypothetical protein  42.35 
 
 		 1268 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.977913  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  43.24 
 
 		 1120 aa  51.6  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2447  hypothetical protein  42.19 
 
 		 718 aa  47.4  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00745  hypothetical protein  30.43 
 
 		 853 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10049  tail component  30.43 
 
 		 853 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3194  putative prophage tail length tape measure protein  50 
 
 		 881 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3126  putative prophage tail length tape measure protein  50 
 
 		 881 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0141545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2768  putative prophage tail length tape measure protein  50 
 
 		 859 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1872  putative prophage tail length tape measure protein  50 
 
 		 881 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179958 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1796  putative prophage tail length tape measure protein  50 
 
 		 881 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132418 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1195  putative prophage tail length tape measure protein  50 
 
 		 859 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1467  tail length tape measure protein  26.33 
 
 		 857 aa  45.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0885  minor tail protein H  27.3 
 
 		 870 aa  46.2  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2104  lambda family phage tail tape measure protein  30.43 
 
 		 853 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000689811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5181  hypothetical protein  31.53 
 
 		 339 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  31.16 
 
 		 1167 aa  43.9  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>