29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1231 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1231  hypothetical protein  100 
 
 		 647 aa  1253    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1880  hypothetical protein  42.83 
 
 		 698 aa  205  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.384763 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  35.09 
 
 		 794 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2351  hypothetical protein  34.54 
 
 		 669 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  51.28 
 
 		 1248 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  51.43 
 
 		 1190 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  53.85 
 
 		 915 aa  71.6  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  57.97 
 
 		 1032 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  34.25 
 
 		 921 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  55.07 
 
 		 1032 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5700  hypothetical protein  56.52 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  51.67 
 
 		 1160 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  53.33 
 
 		 1203 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  57.14 
 
 		 1353 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  53.45 
 
 		 1263 aa  62  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0660  hypothetical protein  29.41 
 
 		 990 aa  60.8  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3708  hypothetical protein  37.5 
 
 		 820 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  34.62 
 
 		 908 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  44.44 
 
 		 1096 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4241  hypothetical protein  43.94 
 
 		 139 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  44.93 
 
 		 914 aa  53.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0873  Methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 701 aa  51.2  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1587  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 1285 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2089  hypothetical protein  27.6 
 
 		 735 aa  48.9  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1311  hypothetical protein  27.6 
 
 		 735 aa  48.9  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3036  peptidase M23B  43.64 
 
 		 1155 aa  48.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  38.81 
 
 		 1192 aa  47  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1175  phage tail tape measure protein, TP901 family  32.11 
 
 		 1343 aa  45.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  33.33 
 
 		 1628 aa  44.3  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>