More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_3036 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009939  Dgeo_3036  peptidase M23B  100 
 
 		 1155 aa  2343    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  37.06 
 
 		 524 aa  69.7  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  35.66 
 
 		 447 aa  67  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  35.66 
 
 		 447 aa  67  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  34.23 
 
 		 316 aa  65.9  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  35.61 
 
 		 442 aa  65.9  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  34.09 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  38.58 
 
 		 453 aa  63.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  37.61 
 
 		 325 aa  62  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  37.84 
 
 		 324 aa  60.8  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  34.53 
 
 		 295 aa  60.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4508  Peptidase M23  36.52 
 
 		 392 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  33.87 
 
 		 303 aa  60.1  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  38.89 
 
 		 347 aa  59.7  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  37.17 
 
 		 284 aa  60.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  34.56 
 
 		 300 aa  59.3  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.1 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  30.27 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  36.36 
 
 		 460 aa  58.5  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  35 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  34.31 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  37.29 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  33.12 
 
 		 455 aa  57.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  33.88 
 
 		 274 aa  57.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  36.36 
 
 		 323 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  30.3 
 
 		 343 aa  57.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  36.22 
 
 		 457 aa  57  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  36.45 
 
 		 464 aa  57  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  41.76 
 
 		 379 aa  57  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  33.05 
 
 		 323 aa  56.6  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4531  Peptidase M23  33.98 
 
 		 137 aa  56.2  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  34.82 
 
 		 464 aa  56.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  32.64 
 
 		 443 aa  56.6  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  32.58 
 
 		 456 aa  56.2  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  30.5 
 
 		 325 aa  55.8  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3592  peptidase M23B  38.24 
 
 		 321 aa  56.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  31.47 
 
 		 272 aa  55.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  33.78 
 
 		 316 aa  55.5  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  35.54 
 
 		 271 aa  55.5  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  33.86 
 
 		 455 aa  55.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  35.43 
 
 		 459 aa  55.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  30.71 
 
 		 334 aa  55.5  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3948  peptidase M23B  38.24 
 
 		 311 aa  55.5  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  25.78 
 
 		 384 aa  55.1  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  37.62 
 
 		 430 aa  55.5  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  26.95 
 
 		 323 aa  55.1  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  32.56 
 
 		 437 aa  55.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  35.58 
 
 		 271 aa  55.1  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  40.45 
 
 		 271 aa  54.7  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3107  Peptidase M23  43.37 
 
 		 304 aa  54.3  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25342  normal  0.558977 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  34.65 
 
 		 605 aa  54.3  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  32.56 
 
 		 440 aa  54.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0146  Peptidase M23  33.96 
 
 		 230 aa  54.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  35.71 
 
 		 283 aa  54.3  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  40.2 
 
 		 398 aa  54.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  32.56 
 
 		 440 aa  54.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  38.83 
 
 		 231 aa  54.3  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  34.11 
 
 		 491 aa  54.3  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  33.7 
 
 		 363 aa  53.5  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  34.58 
 
 		 457 aa  53.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2621  M24/M37 family peptidase  34.95 
 
 		 350 aa  53.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  36.19 
 
 		 404 aa  53.5  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  33.04 
 
 		 282 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  36.45 
 
 		 446 aa  53.5  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  30.08 
 
 		 312 aa  53.1  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0452  pore-forming tail tip protein  34.34 
 
 		 1023 aa  53.1  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102086  normal  0.725254 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  30.08 
 
 		 198 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  33.63 
 
 		 282 aa  53.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  32.32 
 
 		 313 aa  53.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 590 aa  53.1  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  33.33 
 
 		 430 aa  53.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  33.67 
 
 		 340 aa  53.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  34.65 
 
 		 348 aa  53.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  35.96 
 
 		 303 aa  52.8  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  33.86 
 
 		 351 aa  52.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  33.33 
 
 		 312 aa  52.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  39.08 
 
 		 417 aa  52.8  0.00004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  38.04 
 
 		 423 aa  52.8  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2938  M24/M37 family peptidase  34.95 
 
 		 350 aa  52.8  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  31.65 
 
 		 425 aa  52.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  36.19 
 
 		 472 aa  52.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  38.3 
 
 		 465 aa  52.8  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  37.25 
 
 		 266 aa  52.4  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  30.09 
 
 		 275 aa  52.4  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  37.25 
 
 		 273 aa  52.4  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  34.58 
 
 		 454 aa  52.4  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  30.09 
 
 		 275 aa  52.4  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  35.92 
 
 		 412 aa  52.4  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  33.59 
 
 		 727 aa  52.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  34.58 
 
 		 454 aa  52.4  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  29.82 
 
 		 503 aa  52.4  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  29.57 
 
 		 275 aa  52  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  35.51 
 
 		 388 aa  52  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  35.48 
 
 		 470 aa  52  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  33.59 
 
 		 727 aa  52  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  32.11 
 
 		 340 aa  52  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  36.17 
 
 		 270 aa  52  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  33.04 
 
 		 274 aa  51.6  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  34.78 
 
 		 430 aa  51.6  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  27.33 
 
 		 454 aa  51.6  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>