More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3107 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3107  Peptidase M23  100 
 
 		 304 aa  617  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25342  normal  0.558977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3390  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  47.75 
 
 		 342 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5784  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  49.81 
 
 		 306 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159447  normal  0.0159463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4707  Peptidase M23  43.37 
 
 		 294 aa  179  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.440213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6024  Peptidase M23  48.1 
 
 		 194 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6031  hypothetical protein  42.24 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3389  Negative regulator of beta-lactamase expression- like protein  57.66 
 
 		 480 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  56.14 
 
 		 477 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204427  normal  0.0325548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4392  hypothetical protein  51.75 
 
 		 201 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2500  peptidase M23B  39.13 
 
 		 506 aa  105  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3026  Peptidase M23  42.86 
 
 		 433 aa  102  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.43 
 
 		 599 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  44.88 
 
 		 491 aa  92.8  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8081  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.64 
 
 		 769 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.887421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  51.65 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8080  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.86 
 
 		 726 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  47.31 
 
 		 482 aa  87  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  51.65 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  48.39 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  48.39 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  50.54 
 
 		 453 aa  83.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  51.76 
 
 		 376 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  49.46 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  55.7 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  49.43 
 
 		 538 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  50.59 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  47.31 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  43 
 
 		 649 aa  81.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  47.31 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  48.39 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  47.31 
 
 		 459 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  58.73 
 
 		 384 aa  79.7  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  46.24 
 
 		 412 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  45.83 
 
 		 231 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  40.22 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  43.62 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  43.96 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  46.24 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  39.74 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  38.6 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  38.6 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  46.88 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  51.06 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  47.42 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  44.79 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  40.6 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  46.15 
 
 		 482 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  39.84 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  39.84 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  39.53 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  47.25 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  50 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  45.98 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  43.86 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  57.81 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  43.62 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  43.62 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  38.26 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  43.62 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  36.59 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  43.62 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  43.75 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  43.18 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  39.06 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  50.62 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  40.52 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  41.74 
 
 		 447 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  45.16 
 
 		 499 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  47.31 
 
 		 442 aa  76.3  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  41.74 
 
 		 447 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  43.69 
 
 		 472 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  48.84 
 
 		 391 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  44.66 
 
 		 512 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  47.31 
 
 		 450 aa  75.9  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  43.69 
 
 		 471 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  38.6 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  47.87 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  47.87 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  36.3 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  40.35 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  49.44 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  47.87 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  43.69 
 
 		 470 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  47.13 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  43.69 
 
 		 509 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  43.3 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  43.3 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  56.45 
 
 		 470 aa  74.7  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  43.3 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  43.3 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  52.63 
 
 		 523 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  54.1 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  54.1 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  43.3 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  46.51 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  38.1 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  45.28 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  43.3 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  47.62 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  51.76 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>