42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4241 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4241  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  276  7e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  54.43 
 
 		 1190 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  45.87 
 
 		 1248 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  66.07 
 
 		 1160 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  65.45 
 
 		 1353 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  52.22 
 
 		 915 aa  84.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  61.67 
 
 		 1203 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  63.64 
 
 		 1263 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  53.01 
 
 		 1096 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2351  hypothetical protein  42.86 
 
 		 669 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  55.07 
 
 		 921 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  40.52 
 
 		 914 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0873  Methyl-accepting chemotaxis protein  47.83 
 
 		 701 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1587  Lytic transglycosylase catalytic  53.97 
 
 		 1285 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  58.18 
 
 		 794 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0372  hypothetical protein  50.6 
 
 		 968 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  43.84 
 
 		 908 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  59.09 
 
 		 1032 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  59.09 
 
 		 1032 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3126  putative prophage tail length tape measure protein  55.56 
 
 		 881 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0141545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1195  putative prophage tail length tape measure protein  55.56 
 
 		 859 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2768  putative prophage tail length tape measure protein  55.56 
 
 		 859 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3194  putative prophage tail length tape measure protein  55.56 
 
 		 881 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  36.22 
 
 		 1122 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1872  putative prophage tail length tape measure protein  55.56 
 
 		 881 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179958 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1796  putative prophage tail length tape measure protein  55.56 
 
 		 881 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132418 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0885  minor tail protein H  55.56 
 
 		 870 aa  53.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0293  hypothetical protein  44.16 
 
 		 1164 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5700  hypothetical protein  60 
 
 		 457 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  43.33 
 
 		 1120 aa  51.6  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10049  tail component  38.27 
 
 		 853 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1633  putative prophage tail length tape measure protein  38.27 
 
 		 849 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1467  tail length tape measure protein  38.27 
 
 		 857 aa  51.2  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00745  hypothetical protein  38.27 
 
 		 853 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2104  lambda family phage tail tape measure protein  38.27 
 
 		 853 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000689811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  47.37 
 
 		 1192 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1231  hypothetical protein  43.86 
 
 		 647 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  42.03 
 
 		 1628 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2989  hypothetical protein  50 
 
 		 1268 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.977913  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  35.06 
 
 		 1167 aa  47  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1175  phage tail tape measure protein, TP901 family  40.51 
 
 		 1343 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  46.94 
 
 		 1222 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>