46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0638 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0638  hypothetical protein  100 
 
 		 638 aa  1245    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2688  hypothetical protein  44.92 
 
 		 332 aa  171  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1258  hypothetical protein  43.88 
 
 		 289 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5181  hypothetical protein  38.89 
 
 		 339 aa  158  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1659  hypothetical protein  41.71 
 
 		 324 aa  156  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1331  hypothetical protein  42.18 
 
 		 314 aa  156  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3111  hypothetical protein  39.22 
 
 		 339 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2186  hypothetical protein  41.46 
 
 		 377 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.0774004 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3244  hypothetical protein  39.81 
 
 		 364 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.262677  normal  0.336955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3869  hypothetical protein  42.39 
 
 		 346 aa  144  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.649147  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2904  lytic transglycosylase, catalytic  45.6 
 
 		 276 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1844  hypothetical protein  39.69 
 
 		 291 aa  140  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3599  lytic transglycosylase catalytic  34.33 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7204  hypothetical protein  40.86 
 
 		 336 aa  135  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3574  hypothetical protein  41.3 
 
 		 290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2905  Lytic transglycosylase catalytic  34.65 
 
 		 372 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2678  lytic transglycosylase catalytic  34.65 
 
 		 372 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2310  hypothetical protein  37.77 
 
 		 372 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0151599 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2585  hypothetical protein  37.77 
 
 		 372 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2800  Lytic transglycosylase catalytic  33.62 
 
 		 371 aa  125  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2267  hypothetical protein  39.36 
 
 		 370 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6296  hypothetical protein  41.4 
 
 		 343 aa  117  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0268  hypothetical protein  38.8 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4453  hypothetical protein  34.55 
 
 		 360 aa  107  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.01877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2720  hypothetical protein  36.41 
 
 		 361 aa  106  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758469  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2487  hypothetical protein  33.86 
 
 		 377 aa  103  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.867123  normal  0.0497364 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2556  hypothetical protein  34.39 
 
 		 381 aa  103  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2779  hypothetical protein  34.39 
 
 		 381 aa  103  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5198  hypothetical protein  35.48 
 
 		 357 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0902474  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5606  hypothetical protein  37.7 
 
 		 388 aa  101  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2292  lytic transglycosylase catalytic  33.79 
 
 		 387 aa  100  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238503  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3051  hypothetical protein  36.72 
 
 		 435 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0316  Lytic transglycosylase catalytic  34.93 
 
 		 372 aa  92  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0454669  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3074  hypothetical protein  40.97 
 
 		 237 aa  72  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5677  hypothetical protein  36.16 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1096 aa  67.4  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2447  hypothetical protein  37.77 
 
 		 718 aa  62.8  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  39.13 
 
 		 871 aa  57.4  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  33.81 
 
 		 783 aa  57  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3764  hypothetical protein  35.77 
 
 		 274 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0811492  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4086  Transglycosylase domain protein  30.19 
 
 		 1364 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1153  hypothetical protein  32.74 
 
 		 671 aa  54.3  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  33.12 
 
 		 1190 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  32.24 
 
 		 1192 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1032 aa  44.3  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  30.82 
 
 		 1203 aa  43.9  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>