43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2186 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2186  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  739    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.0774004 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3244  hypothetical protein  74.2 
 
 		 364 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.262677  normal  0.336955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3869  hypothetical protein  62.73 
 
 		 346 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.649147  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3111  hypothetical protein  60.62 
 
 		 339 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5181  hypothetical protein  56.22 
 
 		 339 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1659  hypothetical protein  57.02 
 
 		 324 aa  354  2e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1331  hypothetical protein  54.21 
 
 		 314 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2585  hypothetical protein  56.68 
 
 		 372 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2310  hypothetical protein  56.68 
 
 		 372 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0151599 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2688  hypothetical protein  53.89 
 
 		 332 aa  208  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7204  hypothetical protein  53.09 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2267  hypothetical protein  57.22 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0268  hypothetical protein  51.06 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1258  hypothetical protein  50.81 
 
 		 289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1844  hypothetical protein  47.29 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6296  hypothetical protein  54.64 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3574  hypothetical protein  49.74 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0638  hypothetical protein  43.72 
 
 		 638 aa  153  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2904  lytic transglycosylase, catalytic  43.43 
 
 		 276 aa  145  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2678  lytic transglycosylase catalytic  37.38 
 
 		 372 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2905  Lytic transglycosylase catalytic  37.38 
 
 		 372 aa  139  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5198  hypothetical protein  38.46 
 
 		 357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0902474  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2800  Lytic transglycosylase catalytic  36.41 
 
 		 371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4453  hypothetical protein  37.44 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.01877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2556  hypothetical protein  34.95 
 
 		 381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2779  hypothetical protein  34.95 
 
 		 381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2487  hypothetical protein  36.18 
 
 		 377 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.867123  normal  0.0497364 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2720  hypothetical protein  44.21 
 
 		 361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758469  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3599  lytic transglycosylase catalytic  32.03 
 
 		 406 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2292  lytic transglycosylase catalytic  36.76 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238503  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0316  Lytic transglycosylase catalytic  36.23 
 
 		 372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0454669  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3051  hypothetical protein  35.38 
 
 		 435 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5606  hypothetical protein  33.33 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4086  Transglycosylase domain protein  29.74 
 
 		 1364 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  36.81 
 
 		 1096 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5677  hypothetical protein  31.32 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  35.83 
 
 		 871 aa  53.5  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  30.51 
 
 		 783 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3764  hypothetical protein  30.16 
 
 		 274 aa  46.6  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0811492  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1153  hypothetical protein  28.86 
 
 		 671 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5700  hypothetical protein  34.44 
 
 		 457 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3074  hypothetical protein  32.31 
 
 		 237 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2447  hypothetical protein  34.94 
 
 		 718 aa  42.7  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197244  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>