40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5198 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5198  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  720    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0902474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4453  hypothetical protein  86.19 
 
 		 360 aa  624  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.01877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2487  hypothetical protein  56.76 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.867123  normal  0.0497364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2779  hypothetical protein  56.58 
 
 		 381 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2556  hypothetical protein  56.58 
 
 		 381 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5606  hypothetical protein  56.44 
 
 		 388 aa  359  4e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3051  hypothetical protein  60.27 
 
 		 435 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2905  Lytic transglycosylase catalytic  47.27 
 
 		 372 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2678  lytic transglycosylase catalytic  47.27 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2800  Lytic transglycosylase catalytic  42.51 
 
 		 371 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3599  lytic transglycosylase catalytic  44.16 
 
 		 406 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2292  lytic transglycosylase catalytic  47.62 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238503  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0316  Lytic transglycosylase catalytic  47.19 
 
 		 372 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0454669  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1844  hypothetical protein  43.85 
 
 		 291 aa  142  7e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1659  hypothetical protein  39.47 
 
 		 324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1331  hypothetical protein  40 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5181  hypothetical protein  39.71 
 
 		 339 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2310  hypothetical protein  41.44 
 
 		 372 aa  126  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0151599 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2585  hypothetical protein  41.44 
 
 		 372 aa  126  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3111  hypothetical protein  36.36 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3244  hypothetical protein  38.35 
 
 		 364 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.262677  normal  0.336955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3574  hypothetical protein  37.98 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2267  hypothetical protein  41.44 
 
 		 370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0268  hypothetical protein  40.57 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2186  hypothetical protein  38.46 
 
 		 377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.0774004 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1258  hypothetical protein  36.92 
 
 		 289 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2688  hypothetical protein  36.36 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3869  hypothetical protein  37.44 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.649147  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7204  hypothetical protein  39.43 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2904  lytic transglycosylase, catalytic  35.61 
 
 		 276 aa  106  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2720  hypothetical protein  36.36 
 
 		 361 aa  103  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758469  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0638  hypothetical protein  35.48 
 
 		 638 aa  96.7  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6296  hypothetical protein  40 
 
 		 343 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1096 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  35.51 
 
 		 871 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4086  Transglycosylase domain protein  25.17 
 
 		 1364 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3074  hypothetical protein  32.65 
 
 		 237 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  34 
 
 		 783 aa  47.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3764  hypothetical protein  35.05 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0811492  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5677  hypothetical protein  31.21 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>