39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3869 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3869  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  690    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.649147  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3244  hypothetical protein  68.39 
 
 		 364 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.262677  normal  0.336955 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2186  hypothetical protein  63.52 
 
 		 377 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.0774004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3111  hypothetical protein  66.67 
 
 		 339 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1659  hypothetical protein  61.35 
 
 		 324 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5181  hypothetical protein  55.75 
 
 		 339 aa  349  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1331  hypothetical protein  58.82 
 
 		 314 aa  348  1e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2688  hypothetical protein  53.89 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7204  hypothetical protein  54.08 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2585  hypothetical protein  53.19 
 
 		 372 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2310  hypothetical protein  53.19 
 
 		 372 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0151599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2267  hypothetical protein  54.79 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0268  hypothetical protein  52.13 
 
 		 360 aa  189  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1258  hypothetical protein  49.21 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6296  hypothetical protein  54.84 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3574  hypothetical protein  50.26 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1844  hypothetical protein  51.37 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0638  hypothetical protein  42.39 
 
 		 638 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2904  lytic transglycosylase, catalytic  43.94 
 
 		 276 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2556  hypothetical protein  36.61 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2779  hypothetical protein  36.61 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2487  hypothetical protein  37.05 
 
 		 377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.867123  normal  0.0497364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5198  hypothetical protein  35.56 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0902474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4453  hypothetical protein  36.41 
 
 		 360 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.01877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2678  lytic transglycosylase catalytic  35.68 
 
 		 372 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2905  Lytic transglycosylase catalytic  35.68 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3599  lytic transglycosylase catalytic  34.15 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515044 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2800  Lytic transglycosylase catalytic  34.3 
 
 		 371 aa  125  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2292  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 387 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238503  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2720  hypothetical protein  40.11 
 
 		 361 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758469  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5606  hypothetical protein  40.46 
 
 		 388 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3051  hypothetical protein  37.84 
 
 		 435 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0316  Lytic transglycosylase catalytic  36.19 
 
 		 372 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0454669  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4086  Transglycosylase domain protein  28.99 
 
 		 1364 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1096 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  30.68 
 
 		 783 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5677  hypothetical protein  33.11 
 
 		 255 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  35 
 
 		 871 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1153  hypothetical protein  28.76 
 
 		 671 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>