40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1844 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1844  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  575  1.0000000000000001e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2688  hypothetical protein  44.4 
 
 
332 aa  199  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3111  hypothetical protein  47.25 
 
 
339 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5181  hypothetical protein  49.73 
 
 
339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1659  hypothetical protein  52.46 
 
 
324 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2585  hypothetical protein  48.68 
 
 
372 aa  168  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2310  hypothetical protein  49.19 
 
 
372 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0151599 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1331  hypothetical protein  41.89 
 
 
314 aa  165  8e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7204  hypothetical protein  48.44 
 
 
336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2186  hypothetical protein  47.29 
 
 
377 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.0774004 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3244  hypothetical protein  43.48 
 
 
364 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.262677  normal  0.336955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3869  hypothetical protein  51.37 
 
 
346 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.649147  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0268  hypothetical protein  48.62 
 
 
360 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3574  hypothetical protein  46.77 
 
 
290 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2267  hypothetical protein  48.69 
 
 
370 aa  156  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1258  hypothetical protein  43.98 
 
 
289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5198  hypothetical protein  43.85 
 
 
357 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0902474  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2487  hypothetical protein  44.63 
 
 
377 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.867123  normal  0.0497364 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2904  lytic transglycosylase, catalytic  47.25 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2779  hypothetical protein  44.63 
 
 
381 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2556  hypothetical protein  44.63 
 
 
381 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4453  hypothetical protein  42.25 
 
 
360 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.01877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6296  hypothetical protein  49.18 
 
 
343 aa  139  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0638  hypothetical protein  39.69 
 
 
638 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2678  lytic transglycosylase catalytic  42.16 
 
 
372 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2905  Lytic transglycosylase catalytic  42.16 
 
 
372 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5606  hypothetical protein  45.09 
 
 
388 aa  129  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2800  Lytic transglycosylase catalytic  42.16 
 
 
371 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2720  hypothetical protein  41.18 
 
 
361 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758469  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2292  lytic transglycosylase catalytic  42.93 
 
 
387 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238503  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3599  lytic transglycosylase catalytic  41.32 
 
 
406 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000515044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3051  hypothetical protein  45.18 
 
 
435 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0316  Lytic transglycosylase catalytic  45.51 
 
 
372 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0454669  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  32.48 
 
 
1096 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4086  Transglycosylase domain protein  29.09 
 
 
1364 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  35 
 
 
871 aa  52.8  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3074  hypothetical protein  33.6 
 
 
237 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1153  hypothetical protein  33.12 
 
 
671 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5677  hypothetical protein  32.56 
 
 
255 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3764  hypothetical protein  29.51 
 
 
274 aa  43.5  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0811492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>