46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3770 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  100 
 
 		 871 aa  1753    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3074  hypothetical protein  57.43 
 
 		 237 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5677  hypothetical protein  53.42 
 
 		 255 aa  147  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  45.45 
 
 		 783 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  46.58 
 
 		 1096 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3764  hypothetical protein  37.95 
 
 		 274 aa  110  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0811492  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1153  hypothetical protein  44.22 
 
 		 671 aa  108  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  41.55 
 
 		 1190 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  33.03 
 
 		 1263 aa  91.3  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  33.03 
 
 		 1353 aa  91.3  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  36.42 
 
 		 1203 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  45.37 
 
 		 1032 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  38.73 
 
 		 1192 aa  87.4  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  42.14 
 
 		 1032 aa  87.4  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  36.42 
 
 		 1248 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2447  hypothetical protein  35.42 
 
 		 718 aa  68.6  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4086  Transglycosylase domain protein  35.17 
 
 		 1364 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5181  hypothetical protein  35.66 
 
 		 339 aa  63.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2688  hypothetical protein  33.12 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3574  hypothetical protein  35 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5606  hypothetical protein  37.84 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1258  hypothetical protein  33.09 
 
 		 289 aa  57.4  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2487  hypothetical protein  36.51 
 
 		 377 aa  57  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.867123  normal  0.0497364 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2556  hypothetical protein  35.71 
 
 		 381 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2779  hypothetical protein  35.71 
 
 		 381 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1758  hypothetical protein  26.1 
 
 		 808 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000906053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2310  hypothetical protein  36.59 
 
 		 372 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0151599 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2186  hypothetical protein  35.83 
 
 		 377 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.0774004 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2904  lytic transglycosylase, catalytic  33.09 
 
 		 276 aa  53.9  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2585  hypothetical protein  36.59 
 
 		 372 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3599  lytic transglycosylase catalytic  35.83 
 
 		 406 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515044 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1659  hypothetical protein  33.95 
 
 		 324 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3051  hypothetical protein  33.99 
 
 		 435 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3244  hypothetical protein  35.29 
 
 		 364 aa  53.5  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.262677  normal  0.336955 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1844  hypothetical protein  35 
 
 		 291 aa  52.8  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0638  hypothetical protein  38.68 
 
 		 638 aa  52.8  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3869  hypothetical protein  33.33 
 
 		 346 aa  52.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.649147  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5198  hypothetical protein  35.51 
 
 		 357 aa  52  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0902474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4453  hypothetical protein  33.64 
 
 		 360 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.01877 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1331  hypothetical protein  35.29 
 
 		 314 aa  50.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3111  hypothetical protein  33.61 
 
 		 339 aa  50.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0268  hypothetical protein  33.61 
 
 		 360 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2720  hypothetical protein  28.69 
 
 		 361 aa  49.7  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758469  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7204  hypothetical protein  34.07 
 
 		 336 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2267  hypothetical protein  35.4 
 
 		 370 aa  47.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2155  hypothetical protein  54.29 
 
 		 282 aa  47  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.36389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>