39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0268 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0268  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  689    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2585  hypothetical protein  60.31 
 
 		 372 aa  330  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2310  hypothetical protein  59.94 
 
 		 372 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0151599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7204  hypothetical protein  61.54 
 
 		 336 aa  316  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2267  hypothetical protein  58.52 
 
 		 370 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6296  hypothetical protein  58.05 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1331  hypothetical protein  44.85 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1659  hypothetical protein  54.3 
 
 		 324 aa  197  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5181  hypothetical protein  51.26 
 
 		 339 aa  192  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3869  hypothetical protein  51.26 
 
 		 346 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.649147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2186  hypothetical protein  49.02 
 
 		 377 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.0774004 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3244  hypothetical protein  49.51 
 
 		 364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.262677  normal  0.336955 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3111  hypothetical protein  49.46 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2688  hypothetical protein  47.15 
 
 		 332 aa  169  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1844  hypothetical protein  47.4 
 
 		 291 aa  161  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3574  hypothetical protein  48.39 
 
 		 290 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1258  hypothetical protein  46.52 
 
 		 289 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2720  hypothetical protein  45.79 
 
 		 361 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758469  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2556  hypothetical protein  42.94 
 
 		 381 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2779  hypothetical protein  42.94 
 
 		 381 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2904  lytic transglycosylase, catalytic  43.94 
 
 		 276 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2487  hypothetical protein  41.18 
 
 		 377 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.867123  normal  0.0497364 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4453  hypothetical protein  36.82 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.01877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5198  hypothetical protein  39.89 
 
 		 357 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0902474  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2678  lytic transglycosylase catalytic  35.23 
 
 		 372 aa  116  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2905  Lytic transglycosylase catalytic  35.23 
 
 		 372 aa  116  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3051  hypothetical protein  42.94 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5606  hypothetical protein  36.94 
 
 		 388 aa  113  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2800  Lytic transglycosylase catalytic  34.39 
 
 		 371 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3599  lytic transglycosylase catalytic  36.02 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515044 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0638  hypothetical protein  39.13 
 
 		 638 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2292  lytic transglycosylase catalytic  38.62 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238503  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0316  Lytic transglycosylase catalytic  38.62 
 
 		 372 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0454669  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  35.29 
 
 		 1096 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  36.22 
 
 		 783 aa  53.5  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3764  hypothetical protein  33.88 
 
 		 274 aa  52.8  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0811492  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  33.61 
 
 		 871 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4086  Transglycosylase domain protein  28.5 
 
 		 1364 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5677  hypothetical protein  31.28 
 
 		 255 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>