42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2678 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2678  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 372 aa  750    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2800  Lytic transglycosylase catalytic  86.29 
 
 		 371 aa  635    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2905  Lytic transglycosylase catalytic  98.92 
 
 		 372 aa  742    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3599  lytic transglycosylase catalytic  52.91 
 
 		 406 aa  331  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0316  Lytic transglycosylase catalytic  48.19 
 
 		 372 aa  263  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0454669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2292  lytic transglycosylase catalytic  43.35 
 
 		 387 aa  255  7e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238503  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4453  hypothetical protein  47.27 
 
 		 360 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.01877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5198  hypothetical protein  47.27 
 
 		 357 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0902474  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2779  hypothetical protein  44.53 
 
 		 381 aa  200  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2556  hypothetical protein  44.53 
 
 		 381 aa  200  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2487  hypothetical protein  39.36 
 
 		 377 aa  199  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.867123  normal  0.0497364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5606  hypothetical protein  47.77 
 
 		 388 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3051  hypothetical protein  44.24 
 
 		 435 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1258  hypothetical protein  40 
 
 		 289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2904  lytic transglycosylase, catalytic  37.88 
 
 		 276 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2688  hypothetical protein  39.06 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1844  hypothetical protein  42.16 
 
 		 291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3244  hypothetical protein  37.89 
 
 		 364 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.262677  normal  0.336955 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2186  hypothetical protein  37.38 
 
 		 377 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.0774004 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7204  hypothetical protein  38.92 
 
 		 336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1659  hypothetical protein  36.46 
 
 		 324 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3111  hypothetical protein  33.99 
 
 		 339 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1331  hypothetical protein  35.79 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0638  hypothetical protein  34.65 
 
 		 638 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3869  hypothetical protein  35.68 
 
 		 346 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.649147  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2310  hypothetical protein  37.29 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0151599 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2585  hypothetical protein  37.29 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3574  hypothetical protein  41.15 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5181  hypothetical protein  35.48 
 
 		 339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0268  hypothetical protein  35.26 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2267  hypothetical protein  36.72 
 
 		 370 aa  113  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6296  hypothetical protein  39.55 
 
 		 343 aa  106  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2720  hypothetical protein  34.65 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758469  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1096 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4086  Transglycosylase domain protein  25.48 
 
 		 1364 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3764  hypothetical protein  33.6 
 
 		 274 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0811492  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1153  hypothetical protein  27.15 
 
 		 671 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5677  hypothetical protein  29.55 
 
 		 255 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3074  hypothetical protein  31.51 
 
 		 237 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1263 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  29.1 
 
 		 783 aa  43.9  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  33.06 
 
 		 871 aa  43.1  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>