42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1331 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1331  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  627  1e-179  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1659  hypothetical protein  77.09 
 
 		 324 aa  478  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3111  hypothetical protein  62.97 
 
 		 339 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3244  hypothetical protein  57.23 
 
 		 364 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.262677  normal  0.336955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5181  hypothetical protein  57.1 
 
 		 339 aa  330  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3869  hypothetical protein  59.44 
 
 		 346 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.649147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2186  hypothetical protein  54.21 
 
 		 377 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.0774004 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7204  hypothetical protein  46.67 
 
 		 336 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2310  hypothetical protein  45.69 
 
 		 372 aa  209  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0151599 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2585  hypothetical protein  45.69 
 
 		 372 aa  209  7e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0268  hypothetical protein  54.05 
 
 		 360 aa  199  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2267  hypothetical protein  54.74 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2688  hypothetical protein  48.06 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6296  hypothetical protein  55.38 
 
 		 343 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3574  hypothetical protein  51.6 
 
 		 290 aa  168  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1844  hypothetical protein  41.89 
 
 		 291 aa  165  9e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1258  hypothetical protein  46.49 
 
 		 289 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0638  hypothetical protein  43.75 
 
 		 638 aa  150  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2904  lytic transglycosylase, catalytic  47.25 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5198  hypothetical protein  40 
 
 		 357 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0902474  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2720  hypothetical protein  43.09 
 
 		 361 aa  129  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758469  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4453  hypothetical protein  38.95 
 
 		 360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.01877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2556  hypothetical protein  36.92 
 
 		 381 aa  122  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2779  hypothetical protein  36.92 
 
 		 381 aa  122  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2678  lytic transglycosylase catalytic  35.79 
 
 		 372 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2487  hypothetical protein  36.41 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.867123  normal  0.0497364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2905  Lytic transglycosylase catalytic  35.79 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2800  Lytic transglycosylase catalytic  34.74 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2292  lytic transglycosylase catalytic  39.47 
 
 		 387 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238503  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5606  hypothetical protein  41.18 
 
 		 388 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3599  lytic transglycosylase catalytic  34.21 
 
 		 406 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3051  hypothetical protein  40.11 
 
 		 435 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0316  Lytic transglycosylase catalytic  39.47 
 
 		 372 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0454669  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4086  Transglycosylase domain protein  29.44 
 
 		 1364 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  32.93 
 
 		 1096 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5677  hypothetical protein  32.47 
 
 		 255 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  35.29 
 
 		 871 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3764  hypothetical protein  30.16 
 
 		 274 aa  46.6  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0811492  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3074  hypothetical protein  28.16 
 
 		 237 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1153  hypothetical protein  27.88 
 
 		 671 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  29.17 
 
 		 783 aa  43.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2447  hypothetical protein  25.39 
 
 		 718 aa  42.4  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197244  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>