47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1180 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1180  Prophage tail length tape measure  100 
 
 		 1707 aa  3382    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.537045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  31.27 
 
 		 1063 aa  162  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7153  prophage tail length tape measure  31.6 
 
 		 913 aa  133  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553544 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  29.11 
 
 		 914 aa  131  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  26.68 
 
 		 1122 aa  130  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1079  gifsy-1 prophage VmtH  36.44 
 
 		 1028 aa  128  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.497302  normal  0.0993737 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1416  gifsy-1 prophage VmtH  36.44 
 
 		 1028 aa  127  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.312107  hitchhiker  0.00396593 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0703  gifsy-1 prophage VmtH  36.6 
 
 		 1031 aa  127  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1151  gifsy-1 prophage VmtH  35.59 
 
 		 1028 aa  125  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2801  gifsy-1 prophage VmtH  33.81 
 
 		 1031 aa  125  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.617877 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  34.65 
 
 		 1021 aa  119  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  25.8 
 
 		 957 aa  117  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  29.04 
 
 		 908 aa  110  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  35.85 
 
 		 1161 aa  108  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1628  prophage tail length tape measure  36.42 
 
 		 1906 aa  99.4  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.937522  normal  0.73173 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  25.29 
 
 		 1167 aa  99.4  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1782  prophage tail length tape measure  37.74 
 
 		 1835 aa  98.6  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1638  putative tail component of prophage CP-933K  28.05 
 
 		 936 aa  98.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663672  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1517  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  33.01 
 
 		 924 aa  93.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813512  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1716  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  32.54 
 
 		 924 aa  90.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.309525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3255  prophage tail length tape measure  31.28 
 
 		 1555 aa  89.7  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0755523  decreased coverage  0.000000000000332378 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2104  lambda family phage tail tape measure protein  26.02 
 
 		 853 aa  85.9  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000689811  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10049  tail component  24.96 
 
 		 853 aa  85.5  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00745  hypothetical protein  24.96 
 
 		 853 aa  85.5  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1633  putative prophage tail length tape measure protein  28.79 
 
 		 849 aa  84  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  28.34 
 
 		 970 aa  80.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2768  putative prophage tail length tape measure protein  29.63 
 
 		 859 aa  80.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1195  putative prophage tail length tape measure protein  29.63 
 
 		 859 aa  80.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1331  hypothetical protein  48.44 
 
 		 1655 aa  76.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1467  tail length tape measure protein  23.98 
 
 		 857 aa  75.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2059  phage tail tape measure protein  22.88 
 
 		 1673 aa  72.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3328  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1632 aa  67.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.053568 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1636  lambda family phage tail tape measure protein  22.63 
 
 		 1668 aa  66.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3791  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1724 aa  65.5  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3368  hypothetical protein  22.93 
 
 		 1724 aa  64.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0819  tape measure domain-containing protein  36.96 
 
 		 1451 aa  58.2  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060992  normal  0.0141632 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2235  prophage tail length tape measure  36.29 
 
 		 1113 aa  57.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  29.53 
 
 		 1190 aa  56.2  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1872  putative prophage tail length tape measure protein  28.8 
 
 		 881 aa  55.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179958 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3194  putative prophage tail length tape measure protein  28.8 
 
 		 881 aa  55.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0885  minor tail protein H  28.8 
 
 		 870 aa  55.8  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1796  putative prophage tail length tape measure protein  27.15 
 
 		 881 aa  53.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132418 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3126  putative prophage tail length tape measure protein  27.15 
 
 		 881 aa  53.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0141545 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  34.44 
 
 		 1192 aa  52.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1657  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1508 aa  51.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1353 aa  47.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1263 aa  45.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>