38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7153 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7153  prophage tail length tape measure  100 
 
 		 913 aa  1838    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  27.23 
 
 		 1063 aa  115  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  28.62 
 
 		 1021 aa  114  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2485  hypothetical protein  24.88 
 
 		 851 aa  110  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.652813  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0703  gifsy-1 prophage VmtH  28.26 
 
 		 1031 aa  107  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1079  gifsy-1 prophage VmtH  30.63 
 
 		 1028 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.497302  normal  0.0993737 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2801  gifsy-1 prophage VmtH  28.01 
 
 		 1031 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.617877 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1151  gifsy-1 prophage VmtH  30.99 
 
 		 1028 aa  106  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1416  gifsy-1 prophage VmtH  30.63 
 
 		 1028 aa  105  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.312107  hitchhiker  0.00396593 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1180  Prophage tail length tape measure  32.52 
 
 		 1707 aa  100  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.537045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1638  putative tail component of prophage CP-933K  28.42 
 
 		 936 aa  95.1  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663672  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  25.27 
 
 		 1161 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1716  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  29.47 
 
 		 924 aa  87.8  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.309525  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  24.74 
 
 		 1167 aa  87.4  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  26.88 
 
 		 1122 aa  85.1  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  25.33 
 
 		 914 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0537  hypothetical protein  30.38 
 
 		 792 aa  70.9  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.216857 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  26.25 
 
 		 908 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00745  hypothetical protein  24.14 
 
 		 853 aa  65.1  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1633  putative prophage tail length tape measure protein  24.02 
 
 		 849 aa  65.1  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10049  tail component  24.14 
 
 		 853 aa  65.1  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1628  prophage tail length tape measure  24.22 
 
 		 1906 aa  64.7  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.937522  normal  0.73173 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2104  lambda family phage tail tape measure protein  23.87 
 
 		 853 aa  64.3  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000689811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1467  tail length tape measure protein  24.91 
 
 		 857 aa  63.2  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3255  prophage tail length tape measure  23.59 
 
 		 1555 aa  61.6  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0755523  decreased coverage  0.000000000000332378 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1195  putative prophage tail length tape measure protein  24.22 
 
 		 859 aa  61.2  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2768  putative prophage tail length tape measure protein  24.22 
 
 		 859 aa  61.2  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3161  hypothetical protein  25.63 
 
 		 828 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1643  hypothetical protein  25.96 
 
 		 824 aa  58.5  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.304557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1127 aa  57.4  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1096 aa  54.7  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1782  prophage tail length tape measure  23.29 
 
 		 1835 aa  54.7  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2235  prophage tail length tape measure  23.66 
 
 		 1113 aa  53.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  25.33 
 
 		 970 aa  51.6  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  20.44 
 
 		 1032 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3433  hypothetical protein  36.84 
 
 		 613 aa  45.4  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.709149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  21 
 
 		 1032 aa  44.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1993  hypothetical protein  44.44 
 
 		 191 aa  44.3  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0769561  hitchhiker  0.00451154 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>