23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1076 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1076  tail tape meausure protein, putative  100 
 
 		 974 aa  1945    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1889  hypothetical protein  34.06 
 
 		 1006 aa  129  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.405118  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1643  phage tape measure protein  26.6 
 
 		 938 aa  67  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3315  Phage tail tape measure protein  68.18 
 
 		 858 aa  62  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0157558  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  37.6 
 
 		 957 aa  58.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0929  hypothetical protein  42.11 
 
 		 174 aa  58.2  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.333514 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  43.48 
 
 		 781 aa  58.2  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1604  hypothetical protein  58.7 
 
 		 134 aa  57  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993744  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1312  hypothetical protein  58.54 
 
 		 472 aa  55.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  64.29 
 
 		 743 aa  52.8  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2173  tail length tape measure protein  24.05 
 
 		 1080 aa  51.6  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0499654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1549  tail length tape measure protein  24.05 
 
 		 1080 aa  52  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0203252  hitchhiker  0.00310541 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3128  hypothetical protein  56.1 
 
 		 193 aa  50.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3691  hypothetical protein  53.85 
 
 		 902 aa  48.5  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1461  hypothetical protein  20.72 
 
 		 1899 aa  47.4  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1993  hypothetical protein  68.75 
 
 		 191 aa  47.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0769561  hitchhiker  0.00451154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  23.17 
 
 		 1080 aa  47  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2883  tail length tape measure protein  23.24 
 
 		 1080 aa  47  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541295 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  36.67 
 
 		 1628 aa  47  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3078  hypothetical protein  62.5 
 
 		 116 aa  45.8  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6570  hypothetical protein  36.11 
 
 		 341 aa  45.8  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.991993  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3494  hypothetical protein  51.28 
 
 		 852 aa  45.1  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0571399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1000  phage tape measure protein  51.11 
 
 		 991 aa  44.7  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.734571  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>