28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6570 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6570  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  649    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.991993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5968  hypothetical protein  79.92 
 
 		 422 aa  339  4e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0115219  normal  0.340404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7316  hypothetical protein  42.86 
 
 		 674 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198357  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2008  hypothetical protein  43.65 
 
 		 735 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.904662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  43.23 
 
 		 1032 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  40.62 
 
 		 1032 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1000  phage tape measure protein  33.51 
 
 		 991 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0597  hypothetical protein  33.52 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0597  hypothetical protein  34.09 
 
 		 189 aa  57  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0915  phage-related minor tail protein-like protein  31.43 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962484 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1986  gene transfer agent (GTA) orfg11  30.32 
 
 		 188 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.526673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4975  gene transfer agent (GTA) orfg11  50 
 
 		 192 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  hitchhiker  0.000111577 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0929  hypothetical protein  31.61 
 
 		 174 aa  52.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.333514 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3128  hypothetical protein  37.5 
 
 		 193 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1820  gene transfer agent (GTA) like protein  47.06 
 
 		 195 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3596  phage tape measure protein  28.4 
 
 		 632 aa  49.7  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0625908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3462  gene transfer agent (GTA) orfg11  28.19 
 
 		 196 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.251991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0873  Methyl-accepting chemotaxis protein  28.3 
 
 		 701 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1085  hypothetical protein  31.64 
 
 		 217 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0521861 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1349  hypothetical protein  38.03 
 
 		 199 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.0000819599  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1140  putative phage tail minor protein  30.43 
 
 		 216 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.594391 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2475  putative phage tail minor protein  31.07 
 
 		 206 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0334459  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  32.28 
 
 		 794 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2112  gene transfer agent (GTA) like protein  60 
 
 		 197 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631991  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1993  hypothetical protein  68.75 
 
 		 191 aa  44.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0769561  hitchhiker  0.00451154 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1177  gene transfer agent (GTA) like protein  39.74 
 
 		 194 aa  42.7  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0288  hypothetical protein  29.52 
 
 		 781 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.950335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2351  hypothetical protein  42.03 
 
 		 669 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>