24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5968 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5968  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  770    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0115219  normal  0.340404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6570  hypothetical protein  79.58 
 
 		 341 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.991993  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7316  hypothetical protein  43.81 
 
 		 674 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198357  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2008  hypothetical protein  42.49 
 
 		 735 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.904662  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1000  phage tape measure protein  34.01 
 
 		 991 aa  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  39.46 
 
 		 1032 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  85.71 
 
 		 1032 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0915  phage-related minor tail protein-like protein  34.47 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962484 
 
 
-
 
NC_004310  BR0597  hypothetical protein  35.47 
 
 		 181 aa  57  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0597  hypothetical protein  33.5 
 
 		 189 aa  56.2  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0929  hypothetical protein  32.54 
 
 		 174 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.333514 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4975  gene transfer agent (GTA) orfg11  51.35 
 
 		 192 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  hitchhiker  0.000111577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1321  phage tape measure protein  31.25 
 
 		 760 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1312  hypothetical protein  41.38 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1986  gene transfer agent (GTA) orfg11  29.95 
 
 		 188 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.526673 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3128  hypothetical protein  40.74 
 
 		 193 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1349  hypothetical protein  37.14 
 
 		 199 aa  47.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.0000819599  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  32.92 
 
 		 794 aa  47  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2112  gene transfer agent (GTA) like protein  28.11 
 
 		 197 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631991  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1993  hypothetical protein  52.63 
 
 		 191 aa  46.6  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0769561  hitchhiker  0.00451154 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3691  hypothetical protein  44 
 
 		 902 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1820  gene transfer agent (GTA) like protein  42.86 
 
 		 195 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3462  gene transfer agent (GTA) orfg11  40 
 
 		 196 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.251991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0288  hypothetical protein  29.66 
 
 		 781 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.950335  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>