11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1404 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1404  hypothetical protein  100 
 
 		 710 aa  1442    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0226  hypothetical protein  55.85 
 
 		 246 aa  258  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3289  phage tape measure protein  30.8 
 
 		 838 aa  87  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.4409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5328  phage tape measure protein  28.96 
 
 		 837 aa  86.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.227887  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2689  hypothetical protein  28.14 
 
 		 1056 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1643  phage tape measure protein  30.24 
 
 		 938 aa  73.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1331  hypothetical protein  26.25 
 
 		 1655 aa  64.7  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3444  phage tape measure protein  29.83 
 
 		 904 aa  62.4  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22120  hypothetical protein  25.64 
 
 		 774 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000849243  unclonable  1.93803e-21 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0089  putative phage tail tape measure protein  39.77 
 
 		 1521 aa  55.8  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3496  hypothetical protein  22.22 
 
 		 790 aa  45.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0811299  normal  0.0812122 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>