24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4103 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1349  lambda family phage tail tape measure protein  49.44 
 
 		 853 aa  650    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.179371 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4103  hypothetical protein  100 
 
 		 814 aa  1620    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1577  lambda family phage tail tape measure protein  63.89 
 
 		 813 aa  898    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.017316 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1636  lambda family phage tail tape measure protein  48.19 
 
 		 1668 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3328  hypothetical protein  48.55 
 
 		 1632 aa  209  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.053568 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2059  phage tail tape measure protein  47.51 
 
 		 1673 aa  208  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0452  pore-forming tail tip protein  41.92 
 
 		 1023 aa  198  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102086  normal  0.725254 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0634  hypothetical protein  52.08 
 
 		 691 aa  195  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.486011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3708  hypothetical protein  40.7 
 
 		 820 aa  189  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  31.78 
 
 		 908 aa  102  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2994  hypothetical protein  29.61 
 
 		 717 aa  96.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  31.14 
 
 		 1222 aa  80.9  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  25.52 
 
 		 1075 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1549  tail length tape measure protein  22.43 
 
 		 1080 aa  62  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0203252  hitchhiker  0.00310541 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2173  tail length tape measure protein  22.43 
 
 		 1080 aa  62  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0499654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  23.08 
 
 		 1080 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2883  tail length tape measure protein  23.08 
 
 		 1080 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  25.32 
 
 		 1021 aa  58.5  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  27.98 
 
 		 1122 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3962  hypothetical protein  25 
 
 		 671 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.443491 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  26.17 
 
 		 914 aa  51.6  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1626  hypothetical protein  22.27 
 
 		 925 aa  51.2  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3387  hypothetical protein  25.58 
 
 		 715 aa  47.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000202252 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1646  hypothetical protein  25.21 
 
 		 623 aa  44.7  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327516  normal  0.459319 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>