27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3907 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3907  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  325  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.110092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7316  hypothetical protein  38.34 
 
 
674 aa  74.7  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198357  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0929  hypothetical protein  37.01 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.333514 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3128  hypothetical protein  39.74 
 
 
193 aa  64.3  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  60.66 
 
 
957 aa  61.2  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6570  hypothetical protein  34.97 
 
 
341 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.991993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5968  hypothetical protein  35.58 
 
 
422 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0115219  normal  0.340404 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1993  hypothetical protein  53.85 
 
 
191 aa  57.4  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0769561  hitchhiker  0.00451154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2008  hypothetical protein  41.11 
 
 
735 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.904662  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1076  tail tape meausure protein, putative  49.15 
 
 
974 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0915  phage-related minor tail protein-like protein  35.66 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.962484 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3691  hypothetical protein  34.72 
 
 
902 aa  48.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1312  hypothetical protein  54.17 
 
 
472 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1642  Phage-related minor tail protein-like  36 
 
 
222 aa  45.1  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  41.67 
 
 
781 aa  44.7  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0597  hypothetical protein  40 
 
 
181 aa  44.3  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3315  Phage tail tape measure protein  58.97 
 
 
858 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0157558  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0597  hypothetical protein  40 
 
 
189 aa  44.3  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2167  hypothetical protein  32.45 
 
 
222 aa  43.9  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4975  gene transfer agent (GTA) orfg11  41.18 
 
 
192 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  hitchhiker  0.000111577 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1230  hypothetical protein  40.79 
 
 
726 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.909152  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1085  hypothetical protein  29.19 
 
 
217 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0521861 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  63.64 
 
 
743 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0537  hypothetical protein  48 
 
 
792 aa  41.6  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.216857 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1140  putative phage tail minor protein  30.99 
 
 
216 aa  40.8  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.594391 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3462  gene transfer agent (GTA) orfg11  37.39 
 
 
196 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.251991  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2475  putative phage tail minor protein  30.81 
 
 
206 aa  40.8  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0334459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>