14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1606 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1606  hypothetical protein  100 
 
 		 682 aa  1344    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3346  hypothetical protein  45.24 
 
 		 682 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.677729  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3992  hypothetical protein  27.59 
 
 		 738 aa  71.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  31.82 
 
 		 1160 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2477  hypothetical protein  26.39 
 
 		 732 aa  60.8  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  35.66 
 
 		 1127 aa  60.1  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  31.62 
 
 		 1190 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1880  hypothetical protein  33.58 
 
 		 698 aa  53.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.384763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  30.56 
 
 		 1192 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1248 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  29.38 
 
 		 1263 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  32.76 
 
 		 1203 aa  46.6  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0293  hypothetical protein  26.46 
 
 		 1164 aa  45.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1321  phage tape measure protein  63.33 
 
 		 760 aa  44.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459452  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>