More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1044 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1044  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 367 aa  753    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.093004  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2092  lambda family phage portal protein  54.39 
 
 		 524 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.778496  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1445  lambda family phage portal protein  50.53 
 
 		 360 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1887  lambda family phage portal protein  40.8 
 
 		 556 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3064  putative phage portal protein Gp17  39.5 
 
 		 551 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0202724  hitchhiker  0.000118688 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0809  lytic transglycosylase, catalytic  51.26 
 
 		 669 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1168  lytic transglycosylase, catalytic  51.72 
 
 		 669 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0596  phage portal protein, lambda family  33.86 
 
 		 532 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  47.47 
 
 		 241 aa  88.2  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  42.06 
 
 		 260 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  42.06 
 
 		 260 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1658  lambda family phage portal protein  29.44 
 
 		 574 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805551  normal  0.257873 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  42.06 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  42.99 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  44.55 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  44.14 
 
 		 199 aa  78.2  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  41.51 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2287  phage internal core protein  39.68 
 
 		 1569 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  40.54 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  39.25 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5084  lytic transglycosylase catalytic  31.74 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0436378  normal  0.0244706 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  44.04 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  33.33 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  39.71 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  39.22 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  43.36 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4519  lytic transglycosylase catalytic  40.16 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.821488 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  33.81 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  38.68 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  38.68 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  40.38 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  38.68 
 
 		 261 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  38.66 
 
 		 206 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  38.68 
 
 		 261 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  41.9 
 
 		 208 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5136  Lytic transglycosylase catalytic  41.03 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  41.82 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  34.07 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  33.14 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  42.45 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  36.64 
 
 		 295 aa  67  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  42.31 
 
 		 245 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  37.74 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  37.74 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 		 328 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  37.74 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  37.74 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  36.57 
 
 		 279 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  42.11 
 
 		 325 aa  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4537  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.78 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  30.91 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  35.85 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  36.7 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  39.09 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  35.38 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  39.09 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  36.61 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  36.61 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  37.98 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  35.71 
 
 		 438 aa  62.8  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  34.78 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  35.85 
 
 		 238 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  38.05 
 
 		 284 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  37.04 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  38.32 
 
 		 202 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  36.94 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0083  lytic transglycosylase catalytic  39.53 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  38.28 
 
 		 261 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  39 
 
 		 217 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  33.59 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0165  lytic transglycosylase catalytic  39.53 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  42.42 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  35.85 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  35.51 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  38.61 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1133  lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  39.84 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  36.67 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  38.39 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  38.39 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  38.68 
 
 		 495 aa  60.1  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  34.65 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  35.51 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  35.51 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  34.65 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  38.39 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  37.74 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  39.68 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  36.45 
 
 		 198 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  35.78 
 
 		 251 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2210  lytic transglycosylase, catalytic  41.28 
 
 		 218 aa  58.9  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  35.51 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  34.31 
 
 		 216 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  39.22 
 
 		 272 aa  59.3  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  40.19 
 
 		 291 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  37.61 
 
 		 451 aa  58.2  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.518176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  42.16 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  36.72 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  38 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>