56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1445 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1445  lambda family phage portal protein  100 
 
 		 360 aa  742    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2092  lambda family phage portal protein  62.97 
 
 		 524 aa  474  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.778496  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1887  lambda family phage portal protein  48 
 
 		 556 aa  343  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3064  putative phage portal protein Gp17  45.63 
 
 		 551 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0202724  hitchhiker  0.000118688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0596  phage portal protein, lambda family  37.24 
 
 		 532 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1044  lytic transglycosylase, catalytic  50.53 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.093004  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1658  lambda family phage portal protein  34.55 
 
 		 574 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805551  normal  0.257873 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1622  phage portal protein, lambda family  28.62 
 
 		 533 aa  139  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0251357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1785  phage portal protein, lambda family  28.62 
 
 		 533 aa  139  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0988466 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2093  lambda family phage portal protein  27.99 
 
 		 533 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0127798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00733  hypothetical protein  27.94 
 
 		 533 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10038  capsid component  27.94 
 
 		 533 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1288  phage portal protein, lambda family  30.59 
 
 		 530 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1456  phage portal protein, lambda family  30.59 
 
 		 530 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01980  hypothetical protein  28.44 
 
 		 518 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1188  phage portal protein, lambda family  30.16 
 
 		 530 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2775  phage portal protein, lambda family  30.16 
 
 		 530 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2813  phage portal protein lambda family  29.39 
 
 		 526 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.579589 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4921  lambda family phage portal protein  28.8 
 
 		 524 aa  106  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.149822 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1204  lambda family phage portal protein  27.68 
 
 		 531 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4145  lambda family phage portal protein  30 
 
 		 534 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2462  phage portal protein, lambda family  30.04 
 
 		 536 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3207  phage portal protein, lambda family  30.77 
 
 		 499 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0733  Phage portal protein, lambda  27.84 
 
 		 487 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.660834 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0857  bacteriophage-like protein  28.95 
 
 		 508 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2391  phage portal protein, lambda  25.82 
 
 		 538 aa  72.8  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1875  lambda family phage portal protein  29.54 
 
 		 495 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2660  prophage LambdaMc01, lambda family portal protein  28.05 
 
 		 502 aa  70.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2312  Bacteriophage capsid protein  24.27 
 
 		 545 aa  70.1  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3783  bacteriophage-related protein lambda family phage portal protein  28.52 
 
 		 496 aa  69.3  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401598  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3359  lambda family phage portal protein  28.52 
 
 		 496 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2048  lambda family phage portal protein  27.61 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2897  lambda family phage portal protein  27.65 
 
 		 494 aa  67.4  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1260  lambda family phage portal protein  27.65 
 
 		 494 aa  66.6  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1062  lambda family phage portal protein  27.61 
 
 		 517 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.544007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1325  lambda family phage portal protein  27.55 
 
 		 494 aa  61.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3410  portal protein  26.43 
 
 		 493 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.797214  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2576  lambda family phage portal protein  27.55 
 
 		 494 aa  61.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2746  lambda family phage portal protein  27.55 
 
 		 494 aa  61.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3174  phage portal protein, lambda  24.84 
 
 		 536 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2818  lambda family phage portal protein  27.15 
 
 		 494 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1300  phage portal protein, lambda  24.79 
 
 		 537 aa  58.9  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.616273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3432  lambda family phage portal protein  25.42 
 
 		 588 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3044  lambda family phage portal protein  25.28 
 
 		 497 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426475  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1197  lambda family phage portal protein  25.09 
 
 		 488 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6598  lambda family phage portal protein  25.77 
 
 		 512 aa  52.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2512  lambda family phage portal protein  22.02 
 
 		 245 aa  52.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1151  phage-related portal protein  24.1 
 
 		 528 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0412  phage-related portal protein  24.1 
 
 		 528 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1171  lambda family phage portal protein  24.1 
 
 		 528 aa  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0808  Phage portal protein, lambda  27.24 
 
 		 511 aa  47  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.343711  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0281  phage portal protein, lambda family  27.12 
 
 		 539 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4684  lambda family phage portal protein  25.64 
 
 		 500 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1505  lambda family phage portal protein  25.35 
 
 		 516 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1784  lambda family phage portal protein  28.22 
 
 		 431 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5773  phage portal protein, lambda family  22.64 
 
 		 530 aa  43.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>