76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6598 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6598  lambda family phage portal protein  100 
 
 		 512 aa  1045    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0733  Phage portal protein, lambda  42.36 
 
 		 487 aa  349  7e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.660834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2191  lambda family phage portal protein  40.16 
 
 		 497 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000483953 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0808  Phage portal protein, lambda  36.47 
 
 		 511 aa  266  5.999999999999999e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.343711  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1505  lambda family phage portal protein  34.82 
 
 		 516 aa  262  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2308  lambda family phage portal protein  33.6 
 
 		 510 aa  250  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0803517  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1172  phage portal protein, lambda family  33.05 
 
 		 489 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1260  lambda family phage portal protein  34.02 
 
 		 494 aa  239  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2897  lambda family phage portal protein  34.12 
 
 		 494 aa  235  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2048  lambda family phage portal protein  33.54 
 
 		 494 aa  232  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0857  bacteriophage-like protein  34.18 
 
 		 508 aa  226  7e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2660  prophage LambdaMc01, lambda family portal protein  34.19 
 
 		 502 aa  226  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3207  phage portal protein, lambda family  33.47 
 
 		 499 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2818  lambda family phage portal protein  33.74 
 
 		 494 aa  221  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2746  lambda family phage portal protein  33.54 
 
 		 494 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2576  lambda family phage portal protein  33.54 
 
 		 494 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1325  lambda family phage portal protein  33.54 
 
 		 494 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4684  lambda family phage portal protein  31.78 
 
 		 500 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1875  lambda family phage portal protein  31.56 
 
 		 495 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6669  phage portal protein, lambda family  32.83 
 
 		 511 aa  194  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3432  lambda family phage portal protein  30.46 
 
 		 588 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3860  phage portal protein, lambda family  32.68 
 
 		 537 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0281  phage portal protein, lambda family  31.65 
 
 		 539 aa  189  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5773  phage portal protein, lambda family  30.66 
 
 		 530 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1197  lambda family phage portal protein  30.92 
 
 		 488 aa  180  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3044  lambda family phage portal protein  29.08 
 
 		 497 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426475  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2822  lambda family phage portal protein  30.9 
 
 		 472 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3359  lambda family phage portal protein  30.07 
 
 		 496 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3783  bacteriophage-related protein lambda family phage portal protein  29.69 
 
 		 496 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401598  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3410  portal protein  30.13 
 
 		 493 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.797214  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0679  Phage portal protein, lambda  27.23 
 
 		 482 aa  162  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468195  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0120  phage portal protein, lambda  36.8 
 
 		 281 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0615825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0136  lambda family phage portal protein  29.85 
 
 		 443 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1204  lambda family phage portal protein  25.1 
 
 		 531 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3174  phage portal protein, lambda  24.95 
 
 		 536 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1171  lambda family phage portal protein  26.88 
 
 		 528 aa  111  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0412  phage-related portal protein  26.67 
 
 		 528 aa  110  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1151  phage-related portal protein  26.67 
 
 		 528 aa  110  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2254  lambda family phage portal protein  24.6 
 
 		 529 aa  109  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.347018  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1407  phage portal protein, lambda family  25.49 
 
 		 515 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  hitchhiker  0.000144883 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1142  phage portal protein, lambda family  25.49 
 
 		 515 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.57853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1070  phage portal protein lambda family  25.49 
 
 		 515 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.815422  hitchhiker  0.0000926741 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0694  phage portal protein, lambda family  26.56 
 
 		 511 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000299773 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4921  lambda family phage portal protein  24.35 
 
 		 524 aa  99.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.149822 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1300  phage portal protein, lambda  25.54 
 
 		 537 aa  96.7  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.616273 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1863  phage portal protein, lambda family  25.1 
 
 		 500 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3203  phage portal protein, lambda family  25.1 
 
 		 500 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254824 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1784  lambda family phage portal protein  25.31 
 
 		 431 aa  87.8  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1658  lambda family phage portal protein  25.33 
 
 		 574 aa  87.4  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805551  normal  0.257873 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1456  phage portal protein, lambda family  25.58 
 
 		 530 aa  83.6  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0596  phage portal protein, lambda family  25.35 
 
 		 532 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2775  phage portal protein, lambda family  25.16 
 
 		 530 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01980  hypothetical protein  24.69 
 
 		 518 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1188  phage portal protein, lambda family  25.16 
 
 		 530 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1288  phage portal protein, lambda family  25.58 
 
 		 530 aa  82  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  26.76 
 
 		 1156 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2512  lambda family phage portal protein  26.13 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1677  phage portal protein, lambda family protein  26.91 
 
 		 519 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1062  lambda family phage portal protein  24.68 
 
 		 517 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.544007 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00733  hypothetical protein  22.93 
 
 		 533 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1335  Bacteriophage capsid protein-like protein  24.36 
 
 		 466 aa  65.5  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0058198 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10038  capsid component  22.93 
 
 		 533 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0782  phage portal protein, lambda family  25.09 
 
 		 524 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.339104 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0786  lambda family phage portal protein  24.73 
 
 		 524 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0469703 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2092  lambda family phage portal protein  24.87 
 
 		 524 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.778496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0755  lambda family phage portal protein  25.09 
 
 		 524 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3599  lambda family phage portal protein  25.93 
 
 		 524 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2093  lambda family phage portal protein  22.93 
 
 		 533 aa  63.9  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0127798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3250  phage portal protein, lambda  23.91 
 
 		 524 aa  63.5  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1622  phage portal protein, lambda family  22.52 
 
 		 533 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0251357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1785  phage portal protein, lambda family  22.52 
 
 		 533 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0988466 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2813  phage portal protein lambda family  24.2 
 
 		 526 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.579589 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1887  lambda family phage portal protein  22.2 
 
 		 556 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167275 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3545  portal protein lambda  26.52 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0434761  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1445  lambda family phage portal protein  25.77 
 
 		 360 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0370  putative phage related protein  26.07 
 
 		 210 aa  50.8  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>