67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00733 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_00733  hypothetical protein  100 
 
 
533 aa  1108    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10038  capsid component  100 
 
 
533 aa  1108    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2093  lambda family phage portal protein  98.69 
 
 
533 aa  1097    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0127798  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1288  phage portal protein, lambda family  61.23 
 
 
530 aa  639    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1456  phage portal protein, lambda family  61.42 
 
 
530 aa  639    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2813  phage portal protein lambda family  61.36 
 
 
526 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.579589 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1622  phage portal protein, lambda family  98.69 
 
 
533 aa  1095    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0251357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1785  phage portal protein, lambda family  98.69 
 
 
533 aa  1095    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0988466 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1188  phage portal protein, lambda family  60.65 
 
 
530 aa  632  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2775  phage portal protein, lambda family  60.65 
 
 
530 aa  632  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01980  hypothetical protein  55.98 
 
 
518 aa  580  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0895  phage portal protein, lambda family  62.15 
 
 
257 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0596  phage portal protein, lambda family  32.73 
 
 
532 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1887  lambda family phage portal protein  31.52 
 
 
556 aa  238  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167275 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1658  lambda family phage portal protein  30.85 
 
 
574 aa  229  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805551  normal  0.257873 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2092  lambda family phage portal protein  31.03 
 
 
524 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.778496  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3064  putative phage portal protein Gp17  28.88 
 
 
551 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0202724  hitchhiker  0.000118688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2462  phage portal protein, lambda family  26.51 
 
 
536 aa  160  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1204  lambda family phage portal protein  25 
 
 
531 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4145  lambda family phage portal protein  25.1 
 
 
534 aa  140  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178947  normal 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4921  lambda family phage portal protein  25.26 
 
 
524 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.149822 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1062  lambda family phage portal protein  24.63 
 
 
517 aa  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.544007 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1445  lambda family phage portal protein  28.31 
 
 
360 aa  136  9e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2897  lambda family phage portal protein  24.37 
 
 
494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2048  lambda family phage portal protein  23.64 
 
 
494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1260  lambda family phage portal protein  23.63 
 
 
494 aa  109  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2391  phage portal protein, lambda  23.95 
 
 
538 aa  109  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2818  lambda family phage portal protein  24.06 
 
 
494 aa  108  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2576  lambda family phage portal protein  24.43 
 
 
494 aa  108  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2746  lambda family phage portal protein  24.43 
 
 
494 aa  107  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1325  lambda family phage portal protein  24.43 
 
 
494 aa  107  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3359  lambda family phage portal protein  23.89 
 
 
496 aa  100  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3783  bacteriophage-related protein lambda family phage portal protein  23.63 
 
 
496 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401598  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3410  portal protein  22.49 
 
 
493 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.797214  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1197  lambda family phage portal protein  22.27 
 
 
488 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3174  phage portal protein, lambda  21.84 
 
 
536 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3207  phage portal protein, lambda family  22.51 
 
 
499 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2312  Bacteriophage capsid protein  23.03 
 
 
545 aa  80.1  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3044  lambda family phage portal protein  19.88 
 
 
497 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426475  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2660  prophage LambdaMc01, lambda family portal protein  21.68 
 
 
502 aa  78.6  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2822  lambda family phage portal protein  25.38 
 
 
472 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0857  bacteriophage-like protein  20.46 
 
 
508 aa  74.7  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5773  phage portal protein, lambda family  22.41 
 
 
530 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0679  Phage portal protein, lambda  23.91 
 
 
482 aa  70.9  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468195  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0281  phage portal protein, lambda family  21.8 
 
 
539 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592205  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0733  Phage portal protein, lambda  21.82 
 
 
487 aa  67.8  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.660834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6598  lambda family phage portal protein  22.93 
 
 
512 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1172  phage portal protein, lambda family  22.73 
 
 
489 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751074  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3432  lambda family phage portal protein  21.17 
 
 
588 aa  64.7  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2609  phage portal protein, lambda family  37.14 
 
 
127 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.315056 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1784  lambda family phage portal protein  22.94 
 
 
431 aa  57.4  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1875  lambda family phage portal protein  19.23 
 
 
495 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6669  phage portal protein, lambda family  21.32 
 
 
511 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3860  phage portal protein, lambda family  21.29 
 
 
537 aa  52  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0694  phage portal protein, lambda family  27.27 
 
 
511 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000299773 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0412  phage-related portal protein  20.1 
 
 
528 aa  51.2  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1151  phage-related portal protein  20.1 
 
 
528 aa  51.2  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1044  lytic transglycosylase, catalytic  31.78 
 
 
367 aa  50.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.093004  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1171  lambda family phage portal protein  20.43 
 
 
528 aa  50.4  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0136  lambda family phage portal protein  24.08 
 
 
443 aa  50.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1300  phage portal protein, lambda  20.47 
 
 
537 aa  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.616273 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0370  putative phage related protein  22.78 
 
 
210 aa  47.8  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1407  phage portal protein, lambda family  25.56 
 
 
515 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  hitchhiker  0.000144883 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1142  phage portal protein, lambda family  25.56 
 
 
515 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.57853  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1070  phage portal protein lambda family  25.56 
 
 
515 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.815422  hitchhiker  0.0000926741 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1335  Bacteriophage capsid protein-like protein  19.94 
 
 
466 aa  46.2  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0058198 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2254  lambda family phage portal protein  20.76 
 
 
529 aa  45.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.347018  normal  0.189888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>