60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0895 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0895  phage portal protein, lambda family  100 
 
 		 257 aa  528  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1288  phage portal protein, lambda family  99.22 
 
 		 530 aa  520  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1456  phage portal protein, lambda family  99.22 
 
 		 530 aa  520  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2775  phage portal protein, lambda family  96.5 
 
 		 530 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1188  phage portal protein, lambda family  96.5 
 
 		 530 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2813  phage portal protein lambda family  81.27 
 
 		 526 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.579589 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2093  lambda family phage portal protein  62.15 
 
 		 533 aa  322  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0127798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00733  hypothetical protein  62.15 
 
 		 533 aa  321  7e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10038  capsid component  62.15 
 
 		 533 aa  321  7e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1622  phage portal protein, lambda family  62.15 
 
 		 533 aa  321  8e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0251357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1785  phage portal protein, lambda family  62.15 
 
 		 533 aa  321  8e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0988466 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01980  hypothetical protein  57.02 
 
 		 518 aa  291  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1887  lambda family phage portal protein  36.04 
 
 		 556 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167275 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1658  lambda family phage portal protein  35.78 
 
 		 574 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805551  normal  0.257873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0596  phage portal protein, lambda family  34.5 
 
 		 532 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3064  putative phage portal protein Gp17  33.51 
 
 		 551 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0202724  hitchhiker  0.000118688 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2092  lambda family phage portal protein  33.08 
 
 		 524 aa  118  9e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.778496  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1204  lambda family phage portal protein  36.46 
 
 		 531 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1062  lambda family phage portal protein  34.25 
 
 		 517 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.544007 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2462  phage portal protein, lambda family  29.49 
 
 		 536 aa  99  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4145  lambda family phage portal protein  31.06 
 
 		 534 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4921  lambda family phage portal protein  27.01 
 
 		 524 aa  86.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.149822 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2391  phage portal protein, lambda  27.66 
 
 		 538 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2660  prophage LambdaMc01, lambda family portal protein  26.84 
 
 		 502 aa  77.4  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2897  lambda family phage portal protein  28.9 
 
 		 494 aa  75.5  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2818  lambda family phage portal protein  28.32 
 
 		 494 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2746  lambda family phage portal protein  28.32 
 
 		 494 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2576  lambda family phage portal protein  28.32 
 
 		 494 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2048  lambda family phage portal protein  28.32 
 
 		 494 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1325  lambda family phage portal protein  28.32 
 
 		 494 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0857  bacteriophage-like protein  27.75 
 
 		 508 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3174  phage portal protein, lambda  29.59 
 
 		 536 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1260  lambda family phage portal protein  29.94 
 
 		 494 aa  72.8  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3207  phage portal protein, lambda family  27.08 
 
 		 499 aa  72.4  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2609  phage portal protein, lambda family  40.38 
 
 		 127 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.315056 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2312  Bacteriophage capsid protein  25.51 
 
 		 545 aa  68.6  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0281  phage portal protein, lambda family  27.84 
 
 		 539 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0679  Phage portal protein, lambda  25.99 
 
 		 482 aa  65.9  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468195  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5773  phage portal protein, lambda family  26.7 
 
 		 530 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1171  lambda family phage portal protein  26.63 
 
 		 528 aa  60.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0370  putative phage related protein  26.63 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1151  phage-related portal protein  26.63 
 
 		 528 aa  60.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0412  phage-related portal protein  26.63 
 
 		 528 aa  60.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2822  lambda family phage portal protein  28.26 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0733  Phage portal protein, lambda  28.33 
 
 		 487 aa  59.3  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.660834 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3359  lambda family phage portal protein  25.57 
 
 		 496 aa  59.3  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6669  phage portal protein, lambda family  25.29 
 
 		 511 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3783  bacteriophage-related protein lambda family phage portal protein  25 
 
 		 496 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401598  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1784  lambda family phage portal protein  29.11 
 
 		 431 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1875  lambda family phage portal protein  24.14 
 
 		 495 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2308  lambda family phage portal protein  26.47 
 
 		 510 aa  53.9  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0803517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3860  phage portal protein, lambda family  24.71 
 
 		 537 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3410  portal protein  25.4 
 
 		 493 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.797214  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0136  lambda family phage portal protein  28.78 
 
 		 443 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3044  lambda family phage portal protein  21.6 
 
 		 497 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426475  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1197  lambda family phage portal protein  25.83 
 
 		 488 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1172  phage portal protein, lambda family  27.16 
 
 		 489 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0694  phage portal protein, lambda family  27.37 
 
 		 511 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000299773 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0808  Phage portal protein, lambda  27.33 
 
 		 511 aa  43.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.343711  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6598  lambda family phage portal protein  28.85 
 
 		 512 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>