79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6669 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0281  phage portal protein, lambda family  72.53 
 
 		 539 aa  718    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3860  phage portal protein, lambda family  94.73 
 
 		 537 aa  922    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5773  phage portal protein, lambda family  73.19 
 
 		 530 aa  743    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6669  phage portal protein, lambda family  100 
 
 		 511 aa  1037    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0857  bacteriophage-like protein  45.05 
 
 		 508 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2897  lambda family phage portal protein  44.54 
 
 		 494 aa  385  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1260  lambda family phage portal protein  44.54 
 
 		 494 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2048  lambda family phage portal protein  43.49 
 
 		 494 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3207  phage portal protein, lambda family  44.31 
 
 		 499 aa  378  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2660  prophage LambdaMc01, lambda family portal protein  46.53 
 
 		 502 aa  375  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2576  lambda family phage portal protein  43.91 
 
 		 494 aa  360  3e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2746  lambda family phage portal protein  43.91 
 
 		 494 aa  360  4e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1325  lambda family phage portal protein  43.91 
 
 		 494 aa  360  4e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2818  lambda family phage portal protein  43.49 
 
 		 494 aa  358  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1197  lambda family phage portal protein  40.08 
 
 		 488 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3044  lambda family phage portal protein  41.53 
 
 		 497 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426475  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3410  portal protein  41.77 
 
 		 493 aa  339  7e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.797214  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1875  lambda family phage portal protein  38.05 
 
 		 495 aa  326  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3432  lambda family phage portal protein  37.3 
 
 		 588 aa  303  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2822  lambda family phage portal protein  42.25 
 
 		 472 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0679  Phage portal protein, lambda  35.65 
 
 		 482 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468195  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3359  lambda family phage portal protein  37.76 
 
 		 496 aa  279  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3783  bacteriophage-related protein lambda family phage portal protein  38.36 
 
 		 496 aa  276  8e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401598  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0733  Phage portal protein, lambda  37.07 
 
 		 487 aa  242  9e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.660834 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0808  Phage portal protein, lambda  35.9 
 
 		 511 aa  234  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.343711  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2308  lambda family phage portal protein  31.3 
 
 		 510 aa  226  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0803517  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1172  phage portal protein, lambda family  34.79 
 
 		 489 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1505  lambda family phage portal protein  32.52 
 
 		 516 aa  223  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6598  lambda family phage portal protein  32.84 
 
 		 512 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0136  lambda family phage portal protein  35.57 
 
 		 443 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2191  lambda family phage portal protein  30.79 
 
 		 497 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000483953 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4684  lambda family phage portal protein  30.8 
 
 		 500 aa  144  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1204  lambda family phage portal protein  26.37 
 
 		 531 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0120  phage portal protein, lambda  32.83 
 
 		 281 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0615825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4921  lambda family phage portal protein  27.13 
 
 		 524 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.149822 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1658  lambda family phage portal protein  26.14 
 
 		 574 aa  123  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805551  normal  0.257873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0596  phage portal protein, lambda family  27.89 
 
 		 532 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2254  lambda family phage portal protein  25.61 
 
 		 529 aa  120  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.347018  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1863  phage portal protein, lambda family  25.85 
 
 		 500 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3203  phage portal protein, lambda family  25.85 
 
 		 500 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254824 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0412  phage-related portal protein  24.79 
 
 		 528 aa  117  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1171  lambda family phage portal protein  25.16 
 
 		 528 aa  117  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1151  phage-related portal protein  24.79 
 
 		 528 aa  117  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1070  phage portal protein lambda family  25.32 
 
 		 515 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.815422  hitchhiker  0.0000926741 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0694  phage portal protein, lambda family  26.72 
 
 		 511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000299773 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1142  phage portal protein, lambda family  25.32 
 
 		 515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.57853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1407  phage portal protein, lambda family  25.32 
 
 		 515 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  hitchhiker  0.000144883 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3174  phage portal protein, lambda  23.23 
 
 		 536 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  26.61 
 
 		 1156 aa  107  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1300  phage portal protein, lambda  26.21 
 
 		 537 aa  104  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.616273 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1062  lambda family phage portal protein  25.38 
 
 		 517 aa  96.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.544007 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1784  lambda family phage portal protein  24.4 
 
 		 431 aa  96.3  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1677  phage portal protein, lambda family protein  24.42 
 
 		 519 aa  86.7  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3250  phage portal protein, lambda  23.94 
 
 		 524 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3064  putative phage portal protein Gp17  22.69 
 
 		 551 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0202724  hitchhiker  0.000118688 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1887  lambda family phage portal protein  22.3 
 
 		 556 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167275 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0786  lambda family phage portal protein  22.58 
 
 		 524 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0469703 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3599  lambda family phage portal protein  22.58 
 
 		 524 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0755  lambda family phage portal protein  22.58 
 
 		 524 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0782  phage portal protein, lambda family  22.38 
 
 		 524 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.339104 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0370  putative phage related protein  27.62 
 
 		 210 aa  65.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2391  phage portal protein, lambda  23.4 
 
 		 538 aa  65.1  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1456  phage portal protein, lambda family  24.23 
 
 		 530 aa  64.3  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2092  lambda family phage portal protein  23.14 
 
 		 524 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.778496  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1288  phage portal protein, lambda family  23.93 
 
 		 530 aa  61.6  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2462  phage portal protein, lambda family  24.38 
 
 		 536 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2512  lambda family phage portal protein  26.83 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2775  phage portal protein, lambda family  23.78 
 
 		 530 aa  60.1  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1188  phage portal protein, lambda family  23.78 
 
 		 530 aa  60.1  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4145  lambda family phage portal protein  22.35 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178947  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10038  capsid component  21.32 
 
 		 533 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00733  hypothetical protein  21.32 
 
 		 533 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0895  phage portal protein, lambda family  25.29 
 
 		 257 aa  57  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2813  phage portal protein lambda family  21.14 
 
 		 526 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.579589 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1785  phage portal protein, lambda family  21.57 
 
 		 533 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0988466 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1622  phage portal protein, lambda family  21.57 
 
 		 533 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0251357 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2093  lambda family phage portal protein  21.57 
 
 		 533 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0127798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01980  hypothetical protein  22.12 
 
 		 518 aa  50.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1335  Bacteriophage capsid protein-like protein  21.54 
 
 		 466 aa  43.5  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0058198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>