71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4684 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4684  lambda family phage portal protein  100 
 
 		 500 aa  1008    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0808  Phage portal protein, lambda  35.68 
 
 		 511 aa  243  5e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.343711  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1172  phage portal protein, lambda family  34.27 
 
 		 489 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2308  lambda family phage portal protein  33.06 
 
 		 510 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0803517  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0733  Phage portal protein, lambda  34.58 
 
 		 487 aa  233  6e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.660834 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1505  lambda family phage portal protein  32.2 
 
 		 516 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6598  lambda family phage portal protein  31.5 
 
 		 512 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1197  lambda family phage portal protein  31.99 
 
 		 488 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3359  lambda family phage portal protein  31.89 
 
 		 496 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3783  bacteriophage-related protein lambda family phage portal protein  31.89 
 
 		 496 aa  187  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401598  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2191  lambda family phage portal protein  32.29 
 
 		 497 aa  186  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000483953 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3044  lambda family phage portal protein  31.33 
 
 		 497 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426475  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3410  portal protein  32.33 
 
 		 493 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.797214  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0679  Phage portal protein, lambda  31.05 
 
 		 482 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468195  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0857  bacteriophage-like protein  32.87 
 
 		 508 aa  183  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1875  lambda family phage portal protein  30.39 
 
 		 495 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2897  lambda family phage portal protein  32.31 
 
 		 494 aa  177  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1260  lambda family phage portal protein  31.84 
 
 		 494 aa  176  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2048  lambda family phage portal protein  32.31 
 
 		 494 aa  176  8e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5773  phage portal protein, lambda family  31.3 
 
 		 530 aa  172  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2822  lambda family phage portal protein  31.44 
 
 		 472 aa  171  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3432  lambda family phage portal protein  31.16 
 
 		 588 aa  166  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3207  phage portal protein, lambda family  33.86 
 
 		 499 aa  160  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2576  lambda family phage portal protein  32.1 
 
 		 494 aa  160  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2746  lambda family phage portal protein  32.1 
 
 		 494 aa  160  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1325  lambda family phage portal protein  32.1 
 
 		 494 aa  160  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2660  prophage LambdaMc01, lambda family portal protein  33.04 
 
 		 502 aa  159  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2818  lambda family phage portal protein  31.88 
 
 		 494 aa  159  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3860  phage portal protein, lambda family  32.19 
 
 		 537 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0281  phage portal protein, lambda family  30.33 
 
 		 539 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6669  phage portal protein, lambda family  31.36 
 
 		 511 aa  143  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0120  phage portal protein, lambda  30.61 
 
 		 281 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0615825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0136  lambda family phage portal protein  28.12 
 
 		 443 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1204  lambda family phage portal protein  25.7 
 
 		 531 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1784  lambda family phage portal protein  24.88 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1151  phage-related portal protein  26.8 
 
 		 528 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0412  phage-related portal protein  26.8 
 
 		 528 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1171  lambda family phage portal protein  26.55 
 
 		 528 aa  100  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1300  phage portal protein, lambda  27.61 
 
 		 537 aa  99.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.616273 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4921  lambda family phage portal protein  24.74 
 
 		 524 aa  84.3  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.149822 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2254  lambda family phage portal protein  25.1 
 
 		 529 aa  83.2  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.347018  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3174  phage portal protein, lambda  23.2 
 
 		 536 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0694  phage portal protein, lambda family  22.22 
 
 		 511 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000299773 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0370  putative phage related protein  31.21 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1070  phage portal protein lambda family  22.15 
 
 		 515 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.815422  hitchhiker  0.0000926741 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1407  phage portal protein, lambda family  22.15 
 
 		 515 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  hitchhiker  0.000144883 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1062  lambda family phage portal protein  23.12 
 
 		 517 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.544007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1142  phage portal protein, lambda family  21.34 
 
 		 515 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.57853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2092  lambda family phage portal protein  22.8 
 
 		 524 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.778496  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3064  putative phage portal protein Gp17  21.62 
 
 		 551 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0202724  hitchhiker  0.000118688 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3203  phage portal protein, lambda family  22.87 
 
 		 500 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254824 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1863  phage portal protein, lambda family  22.87 
 
 		 500 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353733 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0596  phage portal protein, lambda family  23.81 
 
 		 532 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1658  lambda family phage portal protein  22.4 
 
 		 574 aa  54.7  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805551  normal  0.257873 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1677  phage portal protein, lambda family protein  23.84 
 
 		 519 aa  54.3  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  23.82 
 
 		 1156 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3545  portal protein lambda  24.7 
 
 		 453 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0434761  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3250  phage portal protein, lambda  21.92 
 
 		 524 aa  51.2  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2512  lambda family phage portal protein  22.07 
 
 		 245 aa  51.2  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1887  lambda family phage portal protein  21.36 
 
 		 556 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167275 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2813  phage portal protein lambda family  20.68 
 
 		 526 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.579589 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0755  lambda family phage portal protein  22.2 
 
 		 524 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2128  Bacteriophage capsid protein-like protein  20.57 
 
 		 494 aa  47  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0782  phage portal protein, lambda family  22.2 
 
 		 524 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.339104 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0786  lambda family phage portal protein  21.34 
 
 		 524 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0469703 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1445  lambda family phage portal protein  25.64 
 
 		 360 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3599  lambda family phage portal protein  21.34 
 
 		 524 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1456  phage portal protein, lambda family  23.31 
 
 		 530 aa  43.9  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1188  phage portal protein, lambda family  23.39 
 
 		 530 aa  43.5  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2775  phage portal protein, lambda family  23.39 
 
 		 530 aa  43.5  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1288  phage portal protein, lambda family  23.31 
 
 		 530 aa  43.5  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>