73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1505 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1505  lambda family phage portal protein  100 
 
 
516 aa  1057    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2308  lambda family phage portal protein  56.06 
 
 
510 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0803517  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0808  Phage portal protein, lambda  50.5 
 
 
511 aa  479  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.343711  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0733  Phage portal protein, lambda  40.37 
 
 
487 aa  324  3e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.660834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1172  phage portal protein, lambda family  39.35 
 
 
489 aa  319  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751074  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2048  lambda family phage portal protein  33.55 
 
 
494 aa  272  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2897  lambda family phage portal protein  33.33 
 
 
494 aa  271  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1260  lambda family phage portal protein  33.33 
 
 
494 aa  269  8e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0857  bacteriophage-like protein  34.24 
 
 
508 aa  269  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0120  phage portal protein, lambda  48.71 
 
 
281 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0615825  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6598  lambda family phage portal protein  34.82 
 
 
512 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2746  lambda family phage portal protein  33.76 
 
 
494 aa  253  7e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2576  lambda family phage portal protein  33.76 
 
 
494 aa  253  7e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1325  lambda family phage portal protein  33.76 
 
 
494 aa  253  7e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2818  lambda family phage portal protein  33.76 
 
 
494 aa  251  3e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2660  prophage LambdaMc01, lambda family portal protein  34.38 
 
 
502 aa  249  9e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2191  lambda family phage portal protein  36.11 
 
 
497 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000483953 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3207  phage portal protein, lambda family  33.82 
 
 
499 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1875  lambda family phage portal protein  33.79 
 
 
495 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5773  phage portal protein, lambda family  33.68 
 
 
530 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4684  lambda family phage portal protein  32.2 
 
 
500 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892524  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6669  phage portal protein, lambda family  33.11 
 
 
511 aa  223  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0281  phage portal protein, lambda family  32.63 
 
 
539 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592205  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3860  phage portal protein, lambda family  32.67 
 
 
537 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3432  lambda family phage portal protein  31.41 
 
 
588 aa  216  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3783  bacteriophage-related protein lambda family phage portal protein  31.53 
 
 
496 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401598  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3359  lambda family phage portal protein  31.53 
 
 
496 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2822  lambda family phage portal protein  33.49 
 
 
472 aa  209  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3044  lambda family phage portal protein  29.91 
 
 
497 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426475  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0679  Phage portal protein, lambda  31.79 
 
 
482 aa  207  4e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468195  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3410  portal protein  29.42 
 
 
493 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.797214  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1197  lambda family phage portal protein  30.18 
 
 
488 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1204  lambda family phage portal protein  25 
 
 
531 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3174  phage portal protein, lambda  27.61 
 
 
536 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0136  lambda family phage portal protein  25.37 
 
 
443 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0694  phage portal protein, lambda family  26.37 
 
 
511 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000299773 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1171  lambda family phage portal protein  24.57 
 
 
528 aa  106  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1151  phage-related portal protein  24.78 
 
 
528 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0412  phage-related portal protein  24.78 
 
 
528 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4921  lambda family phage portal protein  23.43 
 
 
524 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.149822 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1784  lambda family phage portal protein  23.74 
 
 
431 aa  96.3  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1407  phage portal protein, lambda family  25.54 
 
 
515 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  hitchhiker  0.000144883 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2254  lambda family phage portal protein  23.84 
 
 
529 aa  94.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.347018  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1142  phage portal protein, lambda family  25.34 
 
 
515 aa  93.6  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.57853  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1070  phage portal protein lambda family  25.34 
 
 
515 aa  93.2  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.815422  hitchhiker  0.0000926741 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1863  phage portal protein, lambda family  23.46 
 
 
500 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3203  phage portal protein, lambda family  23.46 
 
 
500 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254824 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1300  phage portal protein, lambda  23.67 
 
 
537 aa  80.9  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.616273 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2512  lambda family phage portal protein  24.11 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1062  lambda family phage portal protein  22.59 
 
 
517 aa  74.3  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.544007 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1658  lambda family phage portal protein  22.91 
 
 
574 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805551  normal  0.257873 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  24.39 
 
 
1156 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1677  phage portal protein, lambda family protein  24.62 
 
 
519 aa  65.1  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3545  portal protein lambda  22.58 
 
 
453 aa  64.7  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0434761  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3250  phage portal protein, lambda  22.74 
 
 
524 aa  60.1  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2092  lambda family phage portal protein  21.97 
 
 
524 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.778496  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0596  phage portal protein, lambda family  22.1 
 
 
532 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3599  lambda family phage portal protein  22.31 
 
 
524 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0786  lambda family phage portal protein  22.31 
 
 
524 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0469703 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0755  lambda family phage portal protein  22.15 
 
 
524 aa  57.4  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0782  phage portal protein, lambda family  22.15 
 
 
524 aa  57  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.339104 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0370  putative phage related protein  25.47 
 
 
210 aa  55.1  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1887  lambda family phage portal protein  20.38 
 
 
556 aa  51.2  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167275 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2775  phage portal protein, lambda family  22.22 
 
 
530 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1188  phage portal protein, lambda family  22.22 
 
 
530 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2462  phage portal protein, lambda family  21.2 
 
 
536 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1456  phage portal protein, lambda family  22.34 
 
 
530 aa  49.3  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2391  phage portal protein, lambda  30.22 
 
 
538 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3064  putative phage portal protein Gp17  20.21 
 
 
551 aa  47.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0202724  hitchhiker  0.000118688 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1445  lambda family phage portal protein  26.06 
 
 
360 aa  47  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1288  phage portal protein, lambda family  22.22 
 
 
530 aa  46.2  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1335  Bacteriophage capsid protein-like protein  23.33 
 
 
466 aa  44.7  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0058198 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0649  hypothetical protein  27.41 
 
 
171 aa  44.3  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>