73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1784 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1784  lambda family phage portal protein  100 
 
 
431 aa  868    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0136  lambda family phage portal protein  35.91 
 
 
443 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2822  lambda family phage portal protein  32.48 
 
 
472 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2048  lambda family phage portal protein  27.75 
 
 
494 aa  149  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0857  bacteriophage-like protein  28.54 
 
 
508 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2897  lambda family phage portal protein  28.73 
 
 
494 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1260  lambda family phage portal protein  28.51 
 
 
494 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2818  lambda family phage portal protein  27.85 
 
 
494 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2660  prophage LambdaMc01, lambda family portal protein  29.57 
 
 
502 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0733  Phage portal protein, lambda  27.97 
 
 
487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.660834 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3207  phage portal protein, lambda family  29.25 
 
 
499 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2746  lambda family phage portal protein  27.63 
 
 
494 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2576  lambda family phage portal protein  27.63 
 
 
494 aa  141  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1325  lambda family phage portal protein  27.63 
 
 
494 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1172  phage portal protein, lambda family  28.99 
 
 
489 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751074  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3783  bacteriophage-related protein lambda family phage portal protein  28.5 
 
 
496 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401598  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3359  lambda family phage portal protein  28.5 
 
 
496 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0808  Phage portal protein, lambda  28.3 
 
 
511 aa  126  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.343711  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1875  lambda family phage portal protein  28.15 
 
 
495 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5773  phage portal protein, lambda family  25.54 
 
 
530 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0281  phage portal protein, lambda family  26.07 
 
 
539 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592205  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3410  portal protein  27.14 
 
 
493 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.797214  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3044  lambda family phage portal protein  26.52 
 
 
497 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426475  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4684  lambda family phage portal protein  24.88 
 
 
500 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892524  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1197  lambda family phage portal protein  26.83 
 
 
488 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3860  phage portal protein, lambda family  24.82 
 
 
537 aa  99  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6669  phage portal protein, lambda family  24.4 
 
 
511 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1505  lambda family phage portal protein  23.74 
 
 
516 aa  95.9  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0679  Phage portal protein, lambda  23.92 
 
 
482 aa  94  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468195  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1300  phage portal protein, lambda  25.68 
 
 
537 aa  92.4  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.616273 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2308  lambda family phage portal protein  25.3 
 
 
510 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0803517  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6598  lambda family phage portal protein  25.56 
 
 
512 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2191  lambda family phage portal protein  24.87 
 
 
497 aa  87  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000483953 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3174  phage portal protein, lambda  24.36 
 
 
536 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4921  lambda family phage portal protein  24.32 
 
 
524 aa  84.7  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.149822 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1658  lambda family phage portal protein  26.4 
 
 
574 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805551  normal  0.257873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0120  phage portal protein, lambda  27.2 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0615825  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4145  lambda family phage portal protein  26.46 
 
 
534 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178947  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3432  lambda family phage portal protein  24.93 
 
 
588 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1062  lambda family phage portal protein  25.94 
 
 
517 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.544007 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1204  lambda family phage portal protein  24.72 
 
 
531 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0412  phage-related portal protein  25.83 
 
 
528 aa  74.3  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1151  phage-related portal protein  25.83 
 
 
528 aa  74.3  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1171  lambda family phage portal protein  25.53 
 
 
528 aa  73.9  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0596  phage portal protein, lambda family  26.7 
 
 
532 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1456  phage portal protein, lambda family  26.14 
 
 
530 aa  68.2  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1288  phage portal protein, lambda family  26.14 
 
 
530 aa  67.8  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2775  phage portal protein, lambda family  25.84 
 
 
530 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1188  phage portal protein, lambda family  25.84 
 
 
530 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1887  lambda family phage portal protein  25.32 
 
 
556 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167275 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2813  phage portal protein lambda family  25.27 
 
 
526 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.579589 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1142  phage portal protein, lambda family  21.98 
 
 
515 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.57853  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3064  putative phage portal protein Gp17  24.94 
 
 
551 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0202724  hitchhiker  0.000118688 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2092  lambda family phage portal protein  24.94 
 
 
524 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.778496  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1407  phage portal protein, lambda family  21.48 
 
 
515 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  hitchhiker  0.000144883 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0370  putative phage related protein  28.9 
 
 
210 aa  61.2  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1070  phage portal protein lambda family  21.48 
 
 
515 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.815422  hitchhiker  0.0000926741 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00733  hypothetical protein  22.94 
 
 
533 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10038  capsid component  22.94 
 
 
533 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2093  lambda family phage portal protein  22.94 
 
 
533 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0127798  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2254  lambda family phage portal protein  23.01 
 
 
529 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.347018  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1622  phage portal protein, lambda family  22.65 
 
 
533 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0251357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1785  phage portal protein, lambda family  22.65 
 
 
533 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0988466 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0895  phage portal protein, lambda family  29.11 
 
 
257 aa  54.7  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01980  hypothetical protein  20.94 
 
 
518 aa  54.3  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2391  phage portal protein, lambda  23 
 
 
538 aa  50.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1863  phage portal protein, lambda family  22.85 
 
 
500 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3203  phage portal protein, lambda family  22.85 
 
 
500 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254824 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1335  Bacteriophage capsid protein-like protein  20.52 
 
 
466 aa  48.9  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0058198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2462  phage portal protein, lambda family  23.48 
 
 
536 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3250  phage portal protein, lambda  22.1 
 
 
524 aa  47.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0694  phage portal protein, lambda family  22.5 
 
 
511 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000299773 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1445  lambda family phage portal protein  28.22 
 
 
360 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>