68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0370 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0370  putative phage related protein  100 
 
 		 210 aa  436  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1171  lambda family phage portal protein  100 
 
 		 528 aa  434  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1151  phage-related portal protein  97.14 
 
 		 528 aa  424  1e-118  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0412  phage-related portal protein  97.14 
 
 		 528 aa  424  1e-118  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1300  phage portal protein, lambda  38.25 
 
 		 537 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.616273 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3174  phage portal protein, lambda  36.67 
 
 		 536 aa  121  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0857  bacteriophage-like protein  36.21 
 
 		 508 aa  97.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2818  lambda family phage portal protein  32.6 
 
 		 494 aa  97.4  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2746  lambda family phage portal protein  32.6 
 
 		 494 aa  97.8  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1325  lambda family phage portal protein  32.6 
 
 		 494 aa  97.8  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2048  lambda family phage portal protein  32.6 
 
 		 494 aa  97.8  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2576  lambda family phage portal protein  32.6 
 
 		 494 aa  97.4  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189282 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3207  phage portal protein, lambda family  36.26 
 
 		 499 aa  96.3  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2897  lambda family phage portal protein  31.49 
 
 		 494 aa  95.1  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2660  prophage LambdaMc01, lambda family portal protein  34.76 
 
 		 502 aa  95.1  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2822  lambda family phage portal protein  35.16 
 
 		 472 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1260  lambda family phage portal protein  31.49 
 
 		 494 aa  94.4  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0136  lambda family phage portal protein  32.54 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3359  lambda family phage portal protein  30.29 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1197  lambda family phage portal protein  31.86 
 
 		 488 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0733  Phage portal protein, lambda  28.65 
 
 		 487 aa  72  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.660834 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3783  bacteriophage-related protein lambda family phage portal protein  29.71 
 
 		 496 aa  71.6  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401598  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1875  lambda family phage portal protein  30.43 
 
 		 495 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3044  lambda family phage portal protein  28.49 
 
 		 497 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426475  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0596  phage portal protein, lambda family  27.44 
 
 		 532 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4684  lambda family phage portal protein  30.57 
 
 		 500 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0808  Phage portal protein, lambda  31.67 
 
 		 511 aa  66.6  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.343711  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1658  lambda family phage portal protein  28.37 
 
 		 574 aa  66.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805551  normal  0.257873 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0679  Phage portal protein, lambda  29.22 
 
 		 482 aa  65.9  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468195  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6669  phage portal protein, lambda family  27.62 
 
 		 511 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1062  lambda family phage portal protein  27.61 
 
 		 517 aa  65.1  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.544007 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1288  phage portal protein, lambda family  27.17 
 
 		 530 aa  64.3  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1456  phage portal protein, lambda family  27.17 
 
 		 530 aa  64.3  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3860  phage portal protein, lambda family  27.62 
 
 		 537 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0120  phage portal protein, lambda  32.68 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0615825  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3410  portal protein  30.17 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.797214  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2813  phage portal protein lambda family  24.88 
 
 		 526 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.579589 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1887  lambda family phage portal protein  25.99 
 
 		 556 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167275 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2775  phage portal protein, lambda family  27.72 
 
 		 530 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1188  phage portal protein, lambda family  27.72 
 
 		 530 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1784  lambda family phage portal protein  28.9 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0281  phage portal protein, lambda family  28.07 
 
 		 539 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0895  phage portal protein, lambda family  26.63 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5773  phage portal protein, lambda family  27.78 
 
 		 530 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3432  lambda family phage portal protein  26.67 
 
 		 588 aa  58.5  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1505  lambda family phage portal protein  25.47 
 
 		 516 aa  55.5  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1172  phage portal protein, lambda family  27.22 
 
 		 489 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3064  putative phage portal protein Gp17  23.03 
 
 		 551 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0202724  hitchhiker  0.000118688 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2308  lambda family phage portal protein  30.34 
 
 		 510 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0803517  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6598  lambda family phage portal protein  26.07 
 
 		 512 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01980  hypothetical protein  21.79 
 
 		 518 aa  50.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2191  lambda family phage portal protein  24.85 
 
 		 497 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000483953 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1204  lambda family phage portal protein  21.79 
 
 		 531 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2092  lambda family phage portal protein  24.42 
 
 		 524 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.778496  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3203  phage portal protein, lambda family  23.43 
 
 		 500 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254824 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1863  phage portal protein, lambda family  23.43 
 
 		 500 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353733 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1407  phage portal protein, lambda family  23.73 
 
 		 515 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  hitchhiker  0.000144883 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1142  phage portal protein, lambda family  23.73 
 
 		 515 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.57853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1070  phage portal protein lambda family  23.73 
 
 		 515 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.815422  hitchhiker  0.0000926741 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10038  capsid component  22.78 
 
 		 533 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1785  phage portal protein, lambda family  22.78 
 
 		 533 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0988466 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1622  phage portal protein, lambda family  22.78 
 
 		 533 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0251357 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2093  lambda family phage portal protein  22.78 
 
 		 533 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0127798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00733  hypothetical protein  22.78 
 
 		 533 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0694  phage portal protein, lambda family  25 
 
 		 511 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000299773 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2254  lambda family phage portal protein  23.64 
 
 		 529 aa  46.6  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.347018  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3250  phage portal protein, lambda  27.14 
 
 		 524 aa  45.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1677  phage portal protein, lambda family protein  24.64 
 
 		 519 aa  42.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>