82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1062 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1062  lambda family phage portal protein  100 
 
 		 517 aa  1064    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.544007 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1658  lambda family phage portal protein  31.43 
 
 		 574 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805551  normal  0.257873 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2775  phage portal protein, lambda family  29.01 
 
 		 530 aa  168  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1188  phage portal protein, lambda family  29.01 
 
 		 530 aa  168  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1288  phage portal protein, lambda family  28.95 
 
 		 530 aa  167  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1456  phage portal protein, lambda family  28.35 
 
 		 530 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0596  phage portal protein, lambda family  29.44 
 
 		 532 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2813  phage portal protein lambda family  27.48 
 
 		 526 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.579589 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2092  lambda family phage portal protein  30.3 
 
 		 524 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.778496  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1204  lambda family phage portal protein  27.48 
 
 		 531 aa  160  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4921  lambda family phage portal protein  27.03 
 
 		 524 aa  150  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.149822 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10038  capsid component  25.77 
 
 		 533 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1785  phage portal protein, lambda family  25.46 
 
 		 533 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0988466 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1622  phage portal protein, lambda family  25.46 
 
 		 533 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0251357 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00733  hypothetical protein  25.77 
 
 		 533 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2093  lambda family phage portal protein  25.88 
 
 		 533 aa  137  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0127798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1260  lambda family phage portal protein  27.27 
 
 		 494 aa  137  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2897  lambda family phage portal protein  28.14 
 
 		 494 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3207  phage portal protein, lambda family  29.41 
 
 		 499 aa  134  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3064  putative phage portal protein Gp17  26.31 
 
 		 551 aa  134  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0202724  hitchhiker  0.000118688 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3783  bacteriophage-related protein lambda family phage portal protein  26.61 
 
 		 496 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401598  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3359  lambda family phage portal protein  26.61 
 
 		 496 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0857  bacteriophage-like protein  27.4 
 
 		 508 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2048  lambda family phage portal protein  26.42 
 
 		 494 aa  131  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2660  prophage LambdaMc01, lambda family portal protein  27.38 
 
 		 502 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1887  lambda family phage portal protein  26.34 
 
 		 556 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167275 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2822  lambda family phage portal protein  27.84 
 
 		 472 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2576  lambda family phage portal protein  26.83 
 
 		 494 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2818  lambda family phage portal protein  26.83 
 
 		 494 aa  123  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1325  lambda family phage portal protein  28.24 
 
 		 494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2746  lambda family phage portal protein  28.24 
 
 		 494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5773  phage portal protein, lambda family  27.77 
 
 		 530 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3174  phage portal protein, lambda  26.8 
 
 		 536 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1197  lambda family phage portal protein  26.83 
 
 		 488 aa  113  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01980  hypothetical protein  23.16 
 
 		 518 aa  111  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3044  lambda family phage portal protein  27.05 
 
 		 497 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426475  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0281  phage portal protein, lambda family  26.3 
 
 		 539 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2462  phage portal protein, lambda family  25.64 
 
 		 536 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0895  phage portal protein, lambda family  34.25 
 
 		 257 aa  101  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6669  phage portal protein, lambda family  26.3 
 
 		 511 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1875  lambda family phage portal protein  25.6 
 
 		 495 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3860  phage portal protein, lambda family  25.05 
 
 		 537 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0733  Phage portal protein, lambda  26.04 
 
 		 487 aa  96.3  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.660834 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3410  portal protein  26.44 
 
 		 493 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.797214  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1171  lambda family phage portal protein  24.94 
 
 		 528 aa  96.3  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1151  phage-related portal protein  24.94 
 
 		 528 aa  96.7  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0412  phage-related portal protein  24.94 
 
 		 528 aa  96.7  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0136  lambda family phage portal protein  29.72 
 
 		 443 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4145  lambda family phage portal protein  25.1 
 
 		 534 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0808  Phage portal protein, lambda  23.36 
 
 		 511 aa  87  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.343711  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2391  phage portal protein, lambda  22.56 
 
 		 538 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1300  phage portal protein, lambda  24.01 
 
 		 537 aa  81.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.616273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3432  lambda family phage portal protein  23.27 
 
 		 588 aa  81.3  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1172  phage portal protein, lambda family  23.87 
 
 		 489 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0679  Phage portal protein, lambda  22.84 
 
 		 482 aa  77.4  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468195  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2308  lambda family phage portal protein  21.97 
 
 		 510 aa  75.5  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0803517  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1505  lambda family phage portal protein  22.45 
 
 		 516 aa  75.5  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6598  lambda family phage portal protein  25.11 
 
 		 512 aa  74.7  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1784  lambda family phage portal protein  25.94 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4684  lambda family phage portal protein  23.66 
 
 		 500 aa  73.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0786  lambda family phage portal protein  23.9 
 
 		 524 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0469703 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3599  lambda family phage portal protein  23.29 
 
 		 524 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0755  lambda family phage portal protein  23.46 
 
 		 524 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0782  phage portal protein, lambda family  23.46 
 
 		 524 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.339104 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2512  lambda family phage portal protein  26.19 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0120  phage portal protein, lambda  28.1 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0615825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1677  phage portal protein, lambda family protein  23.13 
 
 		 519 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3250  phage portal protein, lambda  22.75 
 
 		 524 aa  66.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2128  Bacteriophage capsid protein-like protein  25.14 
 
 		 494 aa  66.6  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1863  phage portal protein, lambda family  23.53 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  23.76 
 
 		 1156 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3203  phage portal protein, lambda family  23.53 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254824 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0694  phage portal protein, lambda family  20.58 
 
 		 511 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000299773 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1142  phage portal protein, lambda family  21.16 
 
 		 515 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.57853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1070  phage portal protein lambda family  21.15 
 
 		 515 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.815422  hitchhiker  0.0000926741 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1445  lambda family phage portal protein  27.61 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1407  phage portal protein, lambda family  20.89 
 
 		 515 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  hitchhiker  0.000144883 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0370  putative phage related protein  27.61 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2254  lambda family phage portal protein  23.59 
 
 		 529 aa  64.3  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.347018  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2609  phage portal protein, lambda family  33.33 
 
 		 127 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.315056 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2312  Bacteriophage capsid protein  23.58 
 
 		 545 aa  58.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2191  lambda family phage portal protein  24.08 
 
 		 497 aa  47.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000483953 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>