73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1188 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2813  phage portal protein lambda family  82.44 
 
 		 526 aa  886    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.579589 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1188  phage portal protein, lambda family  100 
 
 		 530 aa  1092    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1456  phage portal protein, lambda family  97.74 
 
 		 530 aa  1048    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1288  phage portal protein, lambda family  97.92 
 
 		 530 aa  1047    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2775  phage portal protein, lambda family  100 
 
 		 530 aa  1092    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10038  capsid component  60.65 
 
 		 533 aa  627  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1622  phage portal protein, lambda family  60.38 
 
 		 533 aa  627  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0251357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1785  phage portal protein, lambda family  60.38 
 
 		 533 aa  627  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0988466 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2093  lambda family phage portal protein  60.65 
 
 		 533 aa  627  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0127798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00733  hypothetical protein  60.65 
 
 		 533 aa  627  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01980  hypothetical protein  51.57 
 
 		 518 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0895  phage portal protein, lambda family  96.5 
 
 		 257 aa  506  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1887  lambda family phage portal protein  31.13 
 
 		 556 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167275 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1658  lambda family phage portal protein  32.51 
 
 		 574 aa  234  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805551  normal  0.257873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0596  phage portal protein, lambda family  32.3 
 
 		 532 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2092  lambda family phage portal protein  32.58 
 
 		 524 aa  219  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.778496  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3064  putative phage portal protein Gp17  29.42 
 
 		 551 aa  216  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0202724  hitchhiker  0.000118688 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1062  lambda family phage portal protein  27.87 
 
 		 517 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.544007 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1204  lambda family phage portal protein  27.44 
 
 		 531 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2462  phage portal protein, lambda family  26.92 
 
 		 536 aa  151  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4145  lambda family phage portal protein  27.11 
 
 		 534 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1445  lambda family phage portal protein  29.04 
 
 		 360 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4921  lambda family phage portal protein  24.67 
 
 		 524 aa  129  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.149822 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2897  lambda family phage portal protein  26.23 
 
 		 494 aa  123  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2048  lambda family phage portal protein  26.35 
 
 		 494 aa  123  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2391  phage portal protein, lambda  25.98 
 
 		 538 aa  123  9e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2818  lambda family phage portal protein  26.64 
 
 		 494 aa  120  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1260  lambda family phage portal protein  25.82 
 
 		 494 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2746  lambda family phage portal protein  26.23 
 
 		 494 aa  118  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2576  lambda family phage portal protein  26.23 
 
 		 494 aa  118  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1325  lambda family phage portal protein  26.23 
 
 		 494 aa  118  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3359  lambda family phage portal protein  27.49 
 
 		 496 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3783  bacteriophage-related protein lambda family phage portal protein  27.25 
 
 		 496 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401598  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3174  phage portal protein, lambda  25.88 
 
 		 536 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2660  prophage LambdaMc01, lambda family portal protein  24.35 
 
 		 502 aa  103  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3207  phage portal protein, lambda family  24.3 
 
 		 499 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3410  portal protein  25.19 
 
 		 493 aa  101  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.797214  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0857  bacteriophage-like protein  24.9 
 
 		 508 aa  99  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1197  lambda family phage portal protein  24.61 
 
 		 488 aa  96.7  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1151  phage-related portal protein  25.73 
 
 		 528 aa  93.6  7e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0412  phage-related portal protein  25.73 
 
 		 528 aa  93.6  7e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1171  lambda family phage portal protein  25.73 
 
 		 528 aa  93.6  9e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3044  lambda family phage portal protein  23.61 
 
 		 497 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426475  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2312  Bacteriophage capsid protein  23.57 
 
 		 545 aa  84.7  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0733  Phage portal protein, lambda  24.68 
 
 		 487 aa  84.7  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.660834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6598  lambda family phage portal protein  24.84 
 
 		 512 aa  84  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0679  Phage portal protein, lambda  24.01 
 
 		 482 aa  79.7  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468195  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1875  lambda family phage portal protein  23.32 
 
 		 495 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2822  lambda family phage portal protein  26.43 
 
 		 472 aa  70.1  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2609  phage portal protein, lambda family  40.38 
 
 		 127 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.315056 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1300  phage portal protein, lambda  24.15 
 
 		 537 aa  69.3  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.616273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0281  phage portal protein, lambda family  24.31 
 
 		 539 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3432  lambda family phage portal protein  21.89 
 
 		 588 aa  67.4  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0136  lambda family phage portal protein  25.28 
 
 		 443 aa  67  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1784  lambda family phage portal protein  25.84 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2308  lambda family phage portal protein  23.95 
 
 		 510 aa  64.7  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0803517  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0808  Phage portal protein, lambda  23.58 
 
 		 511 aa  64.7  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.343711  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1172  phage portal protein, lambda family  23.44 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0370  putative phage related protein  27.72 
 
 		 210 aa  62.4  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5773  phage portal protein, lambda family  23.49 
 
 		 530 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2254  lambda family phage portal protein  24.52 
 
 		 529 aa  60.1  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.347018  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6669  phage portal protein, lambda family  23.78 
 
 		 511 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3860  phage portal protein, lambda family  24.68 
 
 		 537 aa  53.9  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1505  lambda family phage portal protein  22.47 
 
 		 516 aa  52  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3250  phage portal protein, lambda  23.45 
 
 		 524 aa  50.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0694  phage portal protein, lambda family  25.91 
 
 		 511 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000299773 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1407  phage portal protein, lambda family  21.35 
 
 		 515 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  hitchhiker  0.000144883 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1070  phage portal protein lambda family  21.43 
 
 		 515 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.815422  hitchhiker  0.0000926741 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2128  Bacteriophage capsid protein-like protein  22.11 
 
 		 494 aa  44.3  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1863  phage portal protein, lambda family  21.63 
 
 		 500 aa  43.9  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3203  phage portal protein, lambda family  21.63 
 
 		 500 aa  43.9  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254824 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1677  phage portal protein, lambda family protein  22.14 
 
 		 519 aa  43.9  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1142  phage portal protein, lambda family  21.43 
 
 		 515 aa  43.9  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.57853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>