69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2308 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2308  lambda family phage portal protein  100 
 
 
510 aa  1047    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0803517  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1505  lambda family phage portal protein  56.06 
 
 
516 aa  561  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0808  Phage portal protein, lambda  46.88 
 
 
511 aa  442  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.343711  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0733  Phage portal protein, lambda  40.08 
 
 
487 aa  328  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.660834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1172  phage portal protein, lambda family  37.63 
 
 
489 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751074  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0120  phage portal protein, lambda  49.03 
 
 
281 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0615825  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1260  lambda family phage portal protein  35.03 
 
 
494 aa  255  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2897  lambda family phage portal protein  34.82 
 
 
494 aa  254  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2048  lambda family phage portal protein  34.75 
 
 
494 aa  253  7e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0857  bacteriophage-like protein  34.27 
 
 
508 aa  248  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2191  lambda family phage portal protein  33.93 
 
 
497 aa  247  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000483953 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3359  lambda family phage portal protein  35.13 
 
 
496 aa  243  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3783  bacteriophage-related protein lambda family phage portal protein  35.13 
 
 
496 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401598  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6598  lambda family phage portal protein  33.6 
 
 
512 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3207  phage portal protein, lambda family  35.14 
 
 
499 aa  236  6e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4684  lambda family phage portal protein  33.06 
 
 
500 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892524  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2746  lambda family phage portal protein  35.46 
 
 
494 aa  236  9e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1325  lambda family phage portal protein  35.46 
 
 
494 aa  236  9e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2576  lambda family phage portal protein  35.46 
 
 
494 aa  236  9e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189282 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2660  prophage LambdaMc01, lambda family portal protein  36.16 
 
 
502 aa  233  5e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2818  lambda family phage portal protein  34.96 
 
 
494 aa  233  8.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5773  phage portal protein, lambda family  32.32 
 
 
530 aa  232  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3860  phage portal protein, lambda family  32.63 
 
 
537 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6669  phage portal protein, lambda family  31.42 
 
 
511 aa  227  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0281  phage portal protein, lambda family  32.98 
 
 
539 aa  223  7e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592205  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2822  lambda family phage portal protein  32.32 
 
 
472 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3044  lambda family phage portal protein  32.52 
 
 
497 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426475  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1875  lambda family phage portal protein  32.12 
 
 
495 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1197  lambda family phage portal protein  32.06 
 
 
488 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0679  Phage portal protein, lambda  31.69 
 
 
482 aa  204  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468195  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3410  portal protein  32.06 
 
 
493 aa  199  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.797214  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3432  lambda family phage portal protein  30.72 
 
 
588 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3174  phage portal protein, lambda  27.39 
 
 
536 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0136  lambda family phage portal protein  27.92 
 
 
443 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1204  lambda family phage portal protein  23.76 
 
 
531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1300  phage portal protein, lambda  26.44 
 
 
537 aa  94.4  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.616273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2254  lambda family phage portal protein  25.24 
 
 
529 aa  93.6  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.347018  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1784  lambda family phage portal protein  25.54 
 
 
431 aa  93.6  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4921  lambda family phage portal protein  22.05 
 
 
524 aa  91.3  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.149822 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0694  phage portal protein, lambda family  23.91 
 
 
511 aa  90.9  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000299773 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1407  phage portal protein, lambda family  24.31 
 
 
515 aa  84  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  hitchhiker  0.000144883 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1070  phage portal protein lambda family  24.11 
 
 
515 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.815422  hitchhiker  0.0000926741 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1142  phage portal protein, lambda family  23.91 
 
 
515 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.57853  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1171  lambda family phage portal protein  22.78 
 
 
528 aa  79  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0412  phage-related portal protein  22.55 
 
 
528 aa  77  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1151  phage-related portal protein  22.55 
 
 
528 aa  77  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2512  lambda family phage portal protein  25.33 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1062  lambda family phage portal protein  21.38 
 
 
517 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.544007 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3203  phage portal protein, lambda family  23.91 
 
 
500 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254824 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1863  phage portal protein, lambda family  23.91 
 
 
500 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353733 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1456  phage portal protein, lambda family  23.95 
 
 
530 aa  63.2  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1188  phage portal protein, lambda family  23.95 
 
 
530 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2775  phage portal protein, lambda family  23.95 
 
 
530 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2092  lambda family phage portal protein  22.52 
 
 
524 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.778496  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1288  phage portal protein, lambda family  23.56 
 
 
530 aa  57.4  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0596  phage portal protein, lambda family  22.05 
 
 
532 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3250  phage portal protein, lambda  23.91 
 
 
524 aa  55.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1658  lambda family phage portal protein  20.59 
 
 
574 aa  55.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805551  normal  0.257873 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1335  Bacteriophage capsid protein-like protein  22.71 
 
 
466 aa  54.7  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0058198 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0370  putative phage related protein  30.34 
 
 
210 aa  54.3  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0895  phage portal protein, lambda family  26.47 
 
 
257 aa  53.5  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3064  putative phage portal protein Gp17  21.43 
 
 
551 aa  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0202724  hitchhiker  0.000118688 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0755  lambda family phage portal protein  23.49 
 
 
524 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3599  lambda family phage portal protein  23.49 
 
 
524 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0786  lambda family phage portal protein  23.49 
 
 
524 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0469703 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1677  phage portal protein, lambda family protein  24.04 
 
 
519 aa  50.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0782  phage portal protein, lambda family  24.56 
 
 
524 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.339104 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2391  phage portal protein, lambda  20.61 
 
 
538 aa  45.8  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1445  lambda family phage portal protein  25 
 
 
360 aa  43.9  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>