50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2512 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2512  lambda family phage portal protein  100 
 
 		 245 aa  499  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1204  lambda family phage portal protein  39.85 
 
 		 531 aa  184  9e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4921  lambda family phage portal protein  39.76 
 
 		 524 aa  182  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.149822 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0733  Phage portal protein, lambda  28.51 
 
 		 487 aa  72.4  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.660834 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2308  lambda family phage portal protein  27.15 
 
 		 510 aa  72  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0803517  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1505  lambda family phage portal protein  24.11 
 
 		 516 aa  71.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0808  Phage portal protein, lambda  24.66 
 
 		 511 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.343711  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1062  lambda family phage portal protein  26.19 
 
 		 517 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.544007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6598  lambda family phage portal protein  26.13 
 
 		 512 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0596  phage portal protein, lambda family  25.43 
 
 		 532 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2048  lambda family phage portal protein  26.06 
 
 		 494 aa  67  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2897  lambda family phage portal protein  27.27 
 
 		 494 aa  66.2  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1172  phage portal protein, lambda family  26.48 
 
 		 489 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1260  lambda family phage portal protein  27.27 
 
 		 494 aa  65.5  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2462  phage portal protein, lambda family  24.26 
 
 		 536 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3860  phage portal protein, lambda family  26.22 
 
 		 537 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6669  phage portal protein, lambda family  26.83 
 
 		 511 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1325  lambda family phage portal protein  26.06 
 
 		 494 aa  58.9  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2746  lambda family phage portal protein  26.06 
 
 		 494 aa  58.9  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2576  lambda family phage portal protein  26.06 
 
 		 494 aa  58.5  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189282 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3783  bacteriophage-related protein lambda family phage portal protein  24.69 
 
 		 496 aa  58.5  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401598  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3359  lambda family phage portal protein  24.69 
 
 		 496 aa  58.5  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0281  phage portal protein, lambda family  25.77 
 
 		 539 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1887  lambda family phage portal protein  25.58 
 
 		 556 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167275 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0857  bacteriophage-like protein  25.81 
 
 		 508 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3207  phage portal protein, lambda family  24.47 
 
 		 499 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2660  prophage LambdaMc01, lambda family portal protein  27.74 
 
 		 502 aa  55.8  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5773  phage portal protein, lambda family  24.07 
 
 		 530 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2818  lambda family phage portal protein  25.45 
 
 		 494 aa  56.2  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2092  lambda family phage portal protein  23.11 
 
 		 524 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.778496  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4145  lambda family phage portal protein  25 
 
 		 534 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3064  putative phage portal protein Gp17  24.4 
 
 		 551 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0202724  hitchhiker  0.000118688 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1875  lambda family phage portal protein  23.04 
 
 		 495 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1197  lambda family phage portal protein  27.41 
 
 		 488 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1445  lambda family phage portal protein  22.02 
 
 		 360 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3410  portal protein  27.5 
 
 		 493 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.797214  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4684  lambda family phage portal protein  22.07 
 
 		 500 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2822  lambda family phage portal protein  25.68 
 
 		 472 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3044  lambda family phage portal protein  27.33 
 
 		 497 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426475  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3174  phage portal protein, lambda  21.3 
 
 		 536 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0679  Phage portal protein, lambda  26.22 
 
 		 482 aa  47.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468195  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1658  lambda family phage portal protein  24.32 
 
 		 574 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805551  normal  0.257873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3432  lambda family phage portal protein  25.74 
 
 		 588 aa  46.6  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2254  lambda family phage portal protein  21.89 
 
 		 529 aa  46.6  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.347018  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2391  phage portal protein, lambda  21.51 
 
 		 538 aa  45.8  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2813  phage portal protein lambda family  19.12 
 
 		 526 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.579589 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1300  phage portal protein, lambda  19.91 
 
 		 537 aa  43.5  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.616273 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2093  lambda family phage portal protein  19.88 
 
 		 533 aa  42.4  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0127798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1142  phage portal protein, lambda family  22.98 
 
 		 515 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.57853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1044  lytic transglycosylase, catalytic  23.6 
 
 		 367 aa  42  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.093004  normal  0.206829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>