64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2462 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2462  phage portal protein, lambda family  100 
 
 		 536 aa  1103    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4145  lambda family phage portal protein  66.05 
 
 		 534 aa  711    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2391  phage portal protein, lambda  36.45 
 
 		 538 aa  289  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2312  Bacteriophage capsid protein  34.33 
 
 		 545 aa  252  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1785  phage portal protein, lambda family  26.82 
 
 		 533 aa  163  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0988466 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1622  phage portal protein, lambda family  26.82 
 
 		 533 aa  163  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0251357 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2093  lambda family phage portal protein  25.99 
 
 		 533 aa  157  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0127798  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10038  capsid component  26.2 
 
 		 533 aa  157  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00733  hypothetical protein  26.2 
 
 		 533 aa  157  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0596  phage portal protein, lambda family  31.56 
 
 		 532 aa  154  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1456  phage portal protein, lambda family  27 
 
 		 530 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1288  phage portal protein, lambda family  26.14 
 
 		 530 aa  153  8e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2092  lambda family phage portal protein  26.64 
 
 		 524 aa  150  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.778496  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01980  hypothetical protein  24.37 
 
 		 518 aa  150  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2775  phage portal protein, lambda family  27 
 
 		 530 aa  150  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1188  phage portal protein, lambda family  27 
 
 		 530 aa  150  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1658  lambda family phage portal protein  27.42 
 
 		 574 aa  149  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805551  normal  0.257873 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2813  phage portal protein lambda family  25.42 
 
 		 526 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.579589 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1204  lambda family phage portal protein  26.63 
 
 		 531 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3064  putative phage portal protein Gp17  24.56 
 
 		 551 aa  127  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0202724  hitchhiker  0.000118688 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1887  lambda family phage portal protein  27.51 
 
 		 556 aa  126  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167275 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4921  lambda family phage portal protein  26.25 
 
 		 524 aa  122  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.149822 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1062  lambda family phage portal protein  25.25 
 
 		 517 aa  103  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.544007 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1445  lambda family phage portal protein  30.04 
 
 		 360 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0895  phage portal protein, lambda family  29.49 
 
 		 257 aa  99  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3783  bacteriophage-related protein lambda family phage portal protein  25.05 
 
 		 496 aa  97.4  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401598  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3359  lambda family phage portal protein  25.05 
 
 		 496 aa  97.1  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2897  lambda family phage portal protein  24.45 
 
 		 494 aa  88.6  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2048  lambda family phage portal protein  24.26 
 
 		 494 aa  88.6  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2660  prophage LambdaMc01, lambda family portal protein  24.2 
 
 		 502 aa  86.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1260  lambda family phage portal protein  24.2 
 
 		 494 aa  85.5  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0857  bacteriophage-like protein  23.55 
 
 		 508 aa  84.3  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2746  lambda family phage portal protein  23.87 
 
 		 494 aa  81.3  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2576  lambda family phage portal protein  23.87 
 
 		 494 aa  80.9  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1325  lambda family phage portal protein  23.87 
 
 		 494 aa  81.3  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1875  lambda family phage portal protein  24.63 
 
 		 495 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3207  phage portal protein, lambda family  24.41 
 
 		 499 aa  80.5  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2818  lambda family phage portal protein  23.47 
 
 		 494 aa  79.3  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0733  Phage portal protein, lambda  23.66 
 
 		 487 aa  73.6  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.660834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1172  phage portal protein, lambda family  24.25 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2822  lambda family phage portal protein  24.31 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0679  Phage portal protein, lambda  19.74 
 
 		 482 aa  67.4  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468195  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2512  lambda family phage portal protein  24.26 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1197  lambda family phage portal protein  22.09 
 
 		 488 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0136  lambda family phage portal protein  27.64 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3410  portal protein  21.99 
 
 		 493 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.797214  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3860  phage portal protein, lambda family  24.47 
 
 		 537 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0808  Phage portal protein, lambda  23.2 
 
 		 511 aa  60.1  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.343711  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3044  lambda family phage portal protein  23 
 
 		 497 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426475  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6669  phage portal protein, lambda family  24.31 
 
 		 511 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1142  phage portal protein, lambda family  22.52 
 
 		 515 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.57853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1070  phage portal protein lambda family  22.35 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.815422  hitchhiker  0.0000926741 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1407  phage portal protein, lambda family  22.35 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  hitchhiker  0.000144883 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1044  lytic transglycosylase, catalytic  27.07 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.093004  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3174  phage portal protein, lambda  22.75 
 
 		 536 aa  53.9  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2254  lambda family phage portal protein  22.82 
 
 		 529 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.347018  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1784  lambda family phage portal protein  23.48 
 
 		 431 aa  48.5  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0281  phage portal protein, lambda family  21.01 
 
 		 539 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5773  phage portal protein, lambda family  22.59 
 
 		 530 aa  47  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1505  lambda family phage portal protein  20.58 
 
 		 516 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0694  phage portal protein, lambda family  22.76 
 
 		 511 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000299773 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1863  phage portal protein, lambda family  21.68 
 
 		 500 aa  46.2  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3203  phage portal protein, lambda family  21.68 
 
 		 500 aa  46.2  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254824 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1300  phage portal protein, lambda  21.78 
 
 		 537 aa  45.4  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.616273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>