79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1300 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1300  phage portal protein, lambda  100 
 
 		 537 aa  1104    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.616273 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1151  phage-related portal protein  38.01 
 
 		 528 aa  360  5e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0412  phage-related portal protein  38.01 
 
 		 528 aa  360  5e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1171  lambda family phage portal protein  38.4 
 
 		 528 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3174  phage portal protein, lambda  32.47 
 
 		 536 aa  245  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2048  lambda family phage portal protein  28.57 
 
 		 494 aa  171  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1260  lambda family phage portal protein  29.09 
 
 		 494 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2897  lambda family phage portal protein  28.88 
 
 		 494 aa  167  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2746  lambda family phage portal protein  28.66 
 
 		 494 aa  162  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2576  lambda family phage portal protein  28.66 
 
 		 494 aa  162  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1325  lambda family phage portal protein  28.66 
 
 		 494 aa  162  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2818  lambda family phage portal protein  28.48 
 
 		 494 aa  162  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0370  putative phage related protein  38.25 
 
 		 210 aa  147  6e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0857  bacteriophage-like protein  27.59 
 
 		 508 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2822  lambda family phage portal protein  28.85 
 
 		 472 aa  136  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3207  phage portal protein, lambda family  27.38 
 
 		 499 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0733  Phage portal protein, lambda  28.72 
 
 		 487 aa  134  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.660834 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2660  prophage LambdaMc01, lambda family portal protein  26.25 
 
 		 502 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1197  lambda family phage portal protein  26.99 
 
 		 488 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2254  lambda family phage portal protein  24.3 
 
 		 529 aa  123  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.347018  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0136  lambda family phage portal protein  31.32 
 
 		 443 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3044  lambda family phage portal protein  26.99 
 
 		 497 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426475  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3783  bacteriophage-related protein lambda family phage portal protein  26.87 
 
 		 496 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401598  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3359  lambda family phage portal protein  26.87 
 
 		 496 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0679  Phage portal protein, lambda  24.57 
 
 		 482 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468195  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5773  phage portal protein, lambda family  26.53 
 
 		 530 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3860  phage portal protein, lambda family  26.94 
 
 		 537 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1875  lambda family phage portal protein  27.08 
 
 		 495 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1172  phage portal protein, lambda family  26.32 
 
 		 489 aa  106  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751074  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3410  portal protein  25.91 
 
 		 493 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.797214  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6669  phage portal protein, lambda family  25.98 
 
 		 511 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0281  phage portal protein, lambda family  26.59 
 
 		 539 aa  103  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0808  Phage portal protein, lambda  28.33 
 
 		 511 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.343711  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0694  phage portal protein, lambda family  23.45 
 
 		 511 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000299773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6598  lambda family phage portal protein  25.07 
 
 		 512 aa  96.7  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1863  phage portal protein, lambda family  23.58 
 
 		 500 aa  92  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353733 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1784  lambda family phage portal protein  25.65 
 
 		 431 aa  92.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2308  lambda family phage portal protein  26.23 
 
 		 510 aa  92.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0803517  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3203  phage portal protein, lambda family  23.58 
 
 		 500 aa  92  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4684  lambda family phage portal protein  27.11 
 
 		 500 aa  92.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3432  lambda family phage portal protein  26.72 
 
 		 588 aa  90.9  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1070  phage portal protein lambda family  24.24 
 
 		 515 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.815422  hitchhiker  0.0000926741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0596  phage portal protein, lambda family  23.61 
 
 		 532 aa  89  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1142  phage portal protein, lambda family  23.15 
 
 		 515 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.57853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1677  phage portal protein, lambda family protein  23.52 
 
 		 519 aa  88.2  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  23.72 
 
 		 1156 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3250  phage portal protein, lambda  23.57 
 
 		 524 aa  87  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1407  phage portal protein, lambda family  23.23 
 
 		 515 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  hitchhiker  0.000144883 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3064  putative phage portal protein Gp17  23.91 
 
 		 551 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0202724  hitchhiker  0.000118688 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1887  lambda family phage portal protein  23.03 
 
 		 556 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167275 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1505  lambda family phage portal protein  23.67 
 
 		 516 aa  80.1  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2191  lambda family phage portal protein  25.21 
 
 		 497 aa  79.7  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000483953 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1062  lambda family phage portal protein  23.7 
 
 		 517 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.544007 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0755  lambda family phage portal protein  21.57 
 
 		 524 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1658  lambda family phage portal protein  24.1 
 
 		 574 aa  78.2  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805551  normal  0.257873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0786  lambda family phage portal protein  21.57 
 
 		 524 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0469703 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0782  phage portal protein, lambda family  21.57 
 
 		 524 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.339104 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3599  lambda family phage portal protein  21.35 
 
 		 524 aa  77  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4921  lambda family phage portal protein  23.09 
 
 		 524 aa  76.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.149822 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2092  lambda family phage portal protein  22.55 
 
 		 524 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.778496  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1456  phage portal protein, lambda family  24.74 
 
 		 530 aa  69.7  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1188  phage portal protein, lambda family  24.15 
 
 		 530 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0120  phage portal protein, lambda  25.29 
 
 		 281 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0615825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2775  phage portal protein, lambda family  24.15 
 
 		 530 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1288  phage portal protein, lambda family  24.15 
 
 		 530 aa  68.2  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1204  lambda family phage portal protein  22.22 
 
 		 531 aa  63.9  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1445  lambda family phage portal protein  24.79 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4145  lambda family phage portal protein  21.56 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01980  hypothetical protein  22.01 
 
 		 518 aa  55.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2813  phage portal protein lambda family  21.88 
 
 		 526 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.579589 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2128  Bacteriophage capsid protein-like protein  21.64 
 
 		 494 aa  53.5  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2093  lambda family phage portal protein  20.83 
 
 		 533 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0127798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1785  phage portal protein, lambda family  20.7 
 
 		 533 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0988466 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1622  phage portal protein, lambda family  20.7 
 
 		 533 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0251357 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10038  capsid component  20.47 
 
 		 533 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00733  hypothetical protein  20.47 
 
 		 533 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2391  phage portal protein, lambda  19.31 
 
 		 538 aa  47.4  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1335  Bacteriophage capsid protein-like protein  22.6 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0058198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2462  phage portal protein, lambda family  21.7 
 
 		 536 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>