38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1335 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1335  Bacteriophage capsid protein-like protein  100 
 
 		 466 aa  961    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0058198 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3783  bacteriophage-related protein lambda family phage portal protein  23.9 
 
 		 496 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401598  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3359  lambda family phage portal protein  23.88 
 
 		 496 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2048  lambda family phage portal protein  25.71 
 
 		 494 aa  73.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2897  lambda family phage portal protein  25.29 
 
 		 494 aa  72.4  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1260  lambda family phage portal protein  25.3 
 
 		 494 aa  70.5  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2128  Bacteriophage capsid protein-like protein  23.36 
 
 		 494 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2818  lambda family phage portal protein  25.51 
 
 		 494 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6598  lambda family phage portal protein  24.36 
 
 		 512 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4921  lambda family phage portal protein  22.47 
 
 		 524 aa  64.7  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.149822 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2576  lambda family phage portal protein  24.64 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1325  lambda family phage portal protein  24.64 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2746  lambda family phage portal protein  24.64 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621282 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3410  portal protein  23.19 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.797214  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1197  lambda family phage portal protein  23.31 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2308  lambda family phage portal protein  22.71 
 
 		 510 aa  54.7  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0803517  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3044  lambda family phage portal protein  19.67 
 
 		 497 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426475  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0679  Phage portal protein, lambda  22.59 
 
 		 482 aa  50.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468195  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1784  lambda family phage portal protein  20.52 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0733  Phage portal protein, lambda  20.67 
 
 		 487 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.660834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0281  phage portal protein, lambda family  21.71 
 
 		 539 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5773  phage portal protein, lambda family  21.98 
 
 		 530 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1172  phage portal protein, lambda family  25.45 
 
 		 489 aa  47.4  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1300  phage portal protein, lambda  22.6 
 
 		 537 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.616273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3432  lambda family phage portal protein  26.72 
 
 		 588 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0857  bacteriophage-like protein  21.96 
 
 		 508 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10038  capsid component  19.94 
 
 		 533 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00733  hypothetical protein  19.94 
 
 		 533 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1785  phage portal protein, lambda family  20.18 
 
 		 533 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0988466 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1622  phage portal protein, lambda family  20.18 
 
 		 533 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0251357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1456  phage portal protein, lambda family  21.81 
 
 		 530 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1505  lambda family phage portal protein  21.38 
 
 		 516 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0808  Phage portal protein, lambda  24.26 
 
 		 511 aa  44.3  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.343711  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2093  lambda family phage portal protein  19.88 
 
 		 533 aa  43.9  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0127798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6669  phage portal protein, lambda family  21.54 
 
 		 511 aa  43.5  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0136  lambda family phage portal protein  20.72 
 
 		 443 aa  43.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1863  phage portal protein, lambda family  24.32 
 
 		 500 aa  43.1  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3203  phage portal protein, lambda family  24.32 
 
 		 500 aa  43.1  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254824 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>