70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1456 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_00733  hypothetical protein  61.42 
 
 		 533 aa  635    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2775  phage portal protein, lambda family  97.74 
 
 		 530 aa  1048    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1188  phage portal protein, lambda family  97.74 
 
 		 530 aa  1048    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2813  phage portal protein lambda family  83.02 
 
 		 526 aa  895    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.579589 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1456  phage portal protein, lambda family  100 
 
 		 530 aa  1092    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1288  phage portal protein, lambda family  99.06 
 
 		 530 aa  1081    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10038  capsid component  61.42 
 
 		 533 aa  635    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1785  phage portal protein, lambda family  60.76 
 
 		 533 aa  632  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0988466 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1622  phage portal protein, lambda family  60.76 
 
 		 533 aa  632  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0251357 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2093  lambda family phage portal protein  61.04 
 
 		 533 aa  632  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0127798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01980  hypothetical protein  51.76 
 
 		 518 aa  541  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0895  phage portal protein, lambda family  99.22 
 
 		 257 aa  520  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1887  lambda family phage portal protein  31.58 
 
 		 556 aa  240  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167275 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1658  lambda family phage portal protein  32.71 
 
 		 574 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805551  normal  0.257873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0596  phage portal protein, lambda family  32.49 
 
 		 532 aa  226  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2092  lambda family phage portal protein  32.58 
 
 		 524 aa  219  7e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.778496  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3064  putative phage portal protein Gp17  29.31 
 
 		 551 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0202724  hitchhiker  0.000118688 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1062  lambda family phage portal protein  27.25 
 
 		 517 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.544007 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1204  lambda family phage portal protein  26.95 
 
 		 531 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2462  phage portal protein, lambda family  26.92 
 
 		 536 aa  154  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4145  lambda family phage portal protein  26.9 
 
 		 534 aa  143  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1445  lambda family phage portal protein  29.4 
 
 		 360 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4921  lambda family phage portal protein  24.81 
 
 		 524 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.149822 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2048  lambda family phage portal protein  26.43 
 
 		 494 aa  127  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2897  lambda family phage portal protein  26.23 
 
 		 494 aa  127  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2818  lambda family phage portal protein  26.64 
 
 		 494 aa  124  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1325  lambda family phage portal protein  26.23 
 
 		 494 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1260  lambda family phage portal protein  25.82 
 
 		 494 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2746  lambda family phage portal protein  26.23 
 
 		 494 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2576  lambda family phage portal protein  26.23 
 
 		 494 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189282 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2391  phage portal protein, lambda  25 
 
 		 538 aa  120  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3359  lambda family phage portal protein  27.29 
 
 		 496 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3783  bacteriophage-related protein lambda family phage portal protein  27.05 
 
 		 496 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401598  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2660  prophage LambdaMc01, lambda family portal protein  23.94 
 
 		 502 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3174  phage portal protein, lambda  25.68 
 
 		 536 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3410  portal protein  25.65 
 
 		 493 aa  107  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.797214  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3207  phage portal protein, lambda family  23.9 
 
 		 499 aa  107  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0857  bacteriophage-like protein  24.3 
 
 		 508 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1197  lambda family phage portal protein  25.15 
 
 		 488 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3044  lambda family phage portal protein  23.75 
 
 		 497 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426475  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1171  lambda family phage portal protein  25 
 
 		 528 aa  94  7e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0412  phage-related portal protein  25.49 
 
 		 528 aa  93.6  8e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1151  phage-related portal protein  25.49 
 
 		 528 aa  93.6  8e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2312  Bacteriophage capsid protein  24.77 
 
 		 545 aa  85.9  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6598  lambda family phage portal protein  25.58 
 
 		 512 aa  84.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0733  Phage portal protein, lambda  24.26 
 
 		 487 aa  84  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.660834 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1875  lambda family phage portal protein  23.52 
 
 		 495 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0679  Phage portal protein, lambda  21.4 
 
 		 482 aa  81.6  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468195  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2822  lambda family phage portal protein  28.23 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2609  phage portal protein, lambda family  40.38 
 
 		 127 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.315056 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3432  lambda family phage portal protein  22.38 
 
 		 588 aa  71.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0281  phage portal protein, lambda family  24.26 
 
 		 539 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0136  lambda family phage portal protein  25.56 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1300  phage portal protein, lambda  24.74 
 
 		 537 aa  69.7  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.616273 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1784  lambda family phage portal protein  26.14 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2308  lambda family phage portal protein  23.95 
 
 		 510 aa  66.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0803517  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0808  Phage portal protein, lambda  24.48 
 
 		 511 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.343711  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1172  phage portal protein, lambda family  23.49 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0370  putative phage related protein  27.17 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6669  phage portal protein, lambda family  24.23 
 
 		 511 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5773  phage portal protein, lambda family  23.49 
 
 		 530 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2254  lambda family phage portal protein  24.52 
 
 		 529 aa  60.1  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.347018  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3860  phage portal protein, lambda family  24.32 
 
 		 537 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1505  lambda family phage portal protein  22.67 
 
 		 516 aa  50.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0694  phage portal protein, lambda family  25.55 
 
 		 511 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000299773 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3250  phage portal protein, lambda  23.06 
 
 		 524 aa  48.5  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1863  phage portal protein, lambda family  20.44 
 
 		 500 aa  46.2  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3203  phage portal protein, lambda family  20.44 
 
 		 500 aa  46.2  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254824 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1335  Bacteriophage capsid protein-like protein  21.59 
 
 		 466 aa  44.7  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0058198 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1677  phage portal protein, lambda family protein  21.88 
 
 		 519 aa  43.5  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>