81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2822 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2822  lambda family phage portal protein  100 
 
 		 472 aa  949    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2897  lambda family phage portal protein  47.35 
 
 		 494 aa  399  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2048  lambda family phage portal protein  46.9 
 
 		 494 aa  399  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1260  lambda family phage portal protein  47.57 
 
 		 494 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2818  lambda family phage portal protein  46.24 
 
 		 494 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2746  lambda family phage portal protein  46.68 
 
 		 494 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2576  lambda family phage portal protein  46.68 
 
 		 494 aa  385  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1325  lambda family phage portal protein  46.68 
 
 		 494 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0857  bacteriophage-like protein  46.29 
 
 		 508 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3207  phage portal protein, lambda family  46.3 
 
 		 499 aa  372  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2660  prophage LambdaMc01, lambda family portal protein  45.43 
 
 		 502 aa  360  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3359  lambda family phage portal protein  45.52 
 
 		 496 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3783  bacteriophage-related protein lambda family phage portal protein  45.52 
 
 		 496 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401598  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3044  lambda family phage portal protein  41.3 
 
 		 497 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426475  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5773  phage portal protein, lambda family  42.38 
 
 		 530 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3860  phage portal protein, lambda family  42.83 
 
 		 537 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1197  lambda family phage portal protein  40.83 
 
 		 488 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6669  phage portal protein, lambda family  42.26 
 
 		 511 aa  315  8e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3410  portal protein  40.25 
 
 		 493 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.797214  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1875  lambda family phage portal protein  39.74 
 
 		 495 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0281  phage portal protein, lambda family  40.04 
 
 		 539 aa  300  5e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0136  lambda family phage portal protein  40.82 
 
 		 443 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0733  Phage portal protein, lambda  36.96 
 
 		 487 aa  268  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.660834 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0679  Phage portal protein, lambda  35.51 
 
 		 482 aa  266  7e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468195  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0808  Phage portal protein, lambda  37.89 
 
 		 511 aa  263  6e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.343711  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1172  phage portal protein, lambda family  36.45 
 
 		 489 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3432  lambda family phage portal protein  33.05 
 
 		 588 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2308  lambda family phage portal protein  31.62 
 
 		 510 aa  219  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0803517  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1505  lambda family phage portal protein  32.24 
 
 		 516 aa  219  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1784  lambda family phage portal protein  32.61 
 
 		 431 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6598  lambda family phage portal protein  30.9 
 
 		 512 aa  186  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0120  phage portal protein, lambda  39.22 
 
 		 281 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0615825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4684  lambda family phage portal protein  31.38 
 
 		 500 aa  174  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2191  lambda family phage portal protein  32.25 
 
 		 497 aa  170  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000483953 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1171  lambda family phage portal protein  32.78 
 
 		 528 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1151  phage-related portal protein  32.55 
 
 		 528 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0412  phage-related portal protein  32.55 
 
 		 528 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1300  phage portal protein, lambda  28.85 
 
 		 537 aa  145  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.616273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2254  lambda family phage portal protein  27.81 
 
 		 529 aa  136  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.347018  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3174  phage portal protein, lambda  28.07 
 
 		 536 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1204  lambda family phage portal protein  27.18 
 
 		 531 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1062  lambda family phage portal protein  27.42 
 
 		 517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.544007 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4921  lambda family phage portal protein  28.29 
 
 		 524 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.149822 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1070  phage portal protein lambda family  26.46 
 
 		 515 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.815422  hitchhiker  0.0000926741 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1142  phage portal protein, lambda family  26.11 
 
 		 515 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.57853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1407  phage portal protein, lambda family  26.23 
 
 		 515 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  hitchhiker  0.000144883 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3250  phage portal protein, lambda  25.76 
 
 		 524 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0694  phage portal protein, lambda family  26.16 
 
 		 511 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000299773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0596  phage portal protein, lambda family  26.13 
 
 		 532 aa  107  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1677  phage portal protein, lambda family protein  24.62 
 
 		 519 aa  106  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0755  lambda family phage portal protein  23.74 
 
 		 524 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0786  lambda family phage portal protein  23.74 
 
 		 524 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0469703 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3599  lambda family phage portal protein  23.74 
 
 		 524 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0782  phage portal protein, lambda family  23.74 
 
 		 524 aa  103  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.339104 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1887  lambda family phage portal protein  25.44 
 
 		 556 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167275 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3203  phage portal protein, lambda family  24.71 
 
 		 500 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254824 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1863  phage portal protein, lambda family  24.71 
 
 		 500 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353733 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0370  putative phage related protein  35.16 
 
 		 210 aa  94.4  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3064  putative phage portal protein Gp17  28.79 
 
 		 551 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0202724  hitchhiker  0.000118688 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1658  lambda family phage portal protein  23.92 
 
 		 574 aa  87  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805551  normal  0.257873 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00733  hypothetical protein  25.53 
 
 		 533 aa  87  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1456  phage portal protein, lambda family  28.23 
 
 		 530 aa  86.7  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10038  capsid component  25.53 
 
 		 533 aa  87  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2093  lambda family phage portal protein  25.53 
 
 		 533 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0127798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1288  phage portal protein, lambda family  27.36 
 
 		 530 aa  86.3  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1622  phage portal protein, lambda family  25.77 
 
 		 533 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0251357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1785  phage portal protein, lambda family  25.77 
 
 		 533 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0988466 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  25.06 
 
 		 1156 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01980  hypothetical protein  24.44 
 
 		 518 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2462  phage portal protein, lambda family  24.64 
 
 		 536 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1188  phage portal protein, lambda family  26 
 
 		 530 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2775  phage portal protein, lambda family  26 
 
 		 530 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2813  phage portal protein lambda family  25.47 
 
 		 526 aa  76.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.579589 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2391  phage portal protein, lambda  21 
 
 		 538 aa  75.1  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2092  lambda family phage portal protein  23.86 
 
 		 524 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.778496  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4145  lambda family phage portal protein  24.38 
 
 		 534 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0895  phage portal protein, lambda family  28.26 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3545  portal protein lambda  24.32 
 
 		 453 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0434761  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2128  Bacteriophage capsid protein-like protein  27.27 
 
 		 494 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2512  lambda family phage portal protein  25.85 
 
 		 245 aa  51.2  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1445  lambda family phage portal protein  23.75 
 
 		 360 aa  44.3  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>