80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3064 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1887  lambda family phage portal protein  62.03 
 
 		 556 aa  726    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3064  putative phage portal protein Gp17  100 
 
 		 551 aa  1128    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0202724  hitchhiker  0.000118688 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2092  lambda family phage portal protein  48.94 
 
 		 524 aa  491  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.778496  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1445  lambda family phage portal protein  45.63 
 
 		 360 aa  320  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0596  phage portal protein, lambda family  37.01 
 
 		 532 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1658  lambda family phage portal protein  33.75 
 
 		 574 aa  293  5e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805551  normal  0.257873 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1785  phage portal protein, lambda family  29.55 
 
 		 533 aa  224  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0988466 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1622  phage portal protein, lambda family  29.55 
 
 		 533 aa  224  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0251357 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2093  lambda family phage portal protein  29.55 
 
 		 533 aa  223  7e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0127798  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10038  capsid component  28.88 
 
 		 533 aa  220  6e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00733  hypothetical protein  28.88 
 
 		 533 aa  220  6e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2775  phage portal protein, lambda family  29.42 
 
 		 530 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1188  phage portal protein, lambda family  29.42 
 
 		 530 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1288  phage portal protein, lambda family  29.74 
 
 		 530 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1456  phage portal protein, lambda family  29 
 
 		 530 aa  211  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01980  hypothetical protein  27.66 
 
 		 518 aa  207  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2813  phage portal protein lambda family  28.04 
 
 		 526 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.579589 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1044  lytic transglycosylase, catalytic  39.5 
 
 		 367 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.093004  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4921  lambda family phage portal protein  26.85 
 
 		 524 aa  143  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.149822 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1204  lambda family phage portal protein  28.66 
 
 		 531 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2391  phage portal protein, lambda  25.05 
 
 		 538 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1062  lambda family phage portal protein  25.9 
 
 		 517 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.544007 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2462  phage portal protein, lambda family  24.56 
 
 		 536 aa  127  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0895  phage portal protein, lambda family  33.51 
 
 		 257 aa  126  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2312  Bacteriophage capsid protein  25.25 
 
 		 545 aa  117  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3174  phage portal protein, lambda  24.85 
 
 		 536 aa  107  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2609  phage portal protein, lambda family  45.54 
 
 		 127 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.315056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3207  phage portal protein, lambda family  26.37 
 
 		 499 aa  104  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2048  lambda family phage portal protein  26.15 
 
 		 494 aa  104  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2746  lambda family phage portal protein  26.36 
 
 		 494 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2576  lambda family phage portal protein  26.36 
 
 		 494 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1325  lambda family phage portal protein  26.36 
 
 		 494 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1260  lambda family phage portal protein  25.74 
 
 		 494 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3783  bacteriophage-related protein lambda family phage portal protein  27.19 
 
 		 496 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401598  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2818  lambda family phage portal protein  26.15 
 
 		 494 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2660  prophage LambdaMc01, lambda family portal protein  26.99 
 
 		 502 aa  101  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3359  lambda family phage portal protein  26.81 
 
 		 496 aa  101  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2897  lambda family phage portal protein  25.74 
 
 		 494 aa  100  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4145  lambda family phage portal protein  23.3 
 
 		 534 aa  100  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178947  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0857  bacteriophage-like protein  27 
 
 		 508 aa  95.1  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1171  lambda family phage portal protein  23.92 
 
 		 528 aa  85.5  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1151  phage-related portal protein  23.71 
 
 		 528 aa  85.9  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0412  phage-related portal protein  23.71 
 
 		 528 aa  85.9  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1300  phage portal protein, lambda  23.91 
 
 		 537 aa  84.7  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.616273 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2822  lambda family phage portal protein  28.79 
 
 		 472 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0733  Phage portal protein, lambda  23.85 
 
 		 487 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.660834 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3203  phage portal protein, lambda family  24.94 
 
 		 500 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254824 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1863  phage portal protein, lambda family  24.94 
 
 		 500 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353733 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1677  phage portal protein, lambda family protein  26.29 
 
 		 519 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6669  phage portal protein, lambda family  23.64 
 
 		 511 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0694  phage portal protein, lambda family  28.84 
 
 		 511 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000299773 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  26.1 
 
 		 1156 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2254  lambda family phage portal protein  24.1 
 
 		 529 aa  73.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.347018  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3860  phage portal protein, lambda family  23.93 
 
 		 537 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3250  phage portal protein, lambda  25.71 
 
 		 524 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0679  Phage portal protein, lambda  23.15 
 
 		 482 aa  67.8  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468195  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0782  phage portal protein, lambda family  25.05 
 
 		 524 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.339104 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0755  lambda family phage portal protein  24.4 
 
 		 524 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0786  lambda family phage portal protein  24.18 
 
 		 524 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0469703 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3599  lambda family phage portal protein  24.4 
 
 		 524 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1407  phage portal protein, lambda family  22.98 
 
 		 515 aa  65.1  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  hitchhiker  0.000144883 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1070  phage portal protein lambda family  22.93 
 
 		 515 aa  63.9  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.815422  hitchhiker  0.0000926741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5773  phage portal protein, lambda family  23.29 
 
 		 530 aa  63.9  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1784  lambda family phage portal protein  24.94 
 
 		 431 aa  63.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1875  lambda family phage portal protein  22.04 
 
 		 495 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1142  phage portal protein, lambda family  22.93 
 
 		 515 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.57853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3432  lambda family phage portal protein  22.11 
 
 		 588 aa  57.8  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0808  Phage portal protein, lambda  23.86 
 
 		 511 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.343711  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0281  phage portal protein, lambda family  21.18 
 
 		 539 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0370  putative phage related protein  23.03 
 
 		 210 aa  55.5  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2512  lambda family phage portal protein  24.4 
 
 		 245 aa  54.7  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3410  portal protein  21.52 
 
 		 493 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.797214  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1197  lambda family phage portal protein  21.46 
 
 		 488 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3044  lambda family phage portal protein  22.15 
 
 		 497 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426475  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0136  lambda family phage portal protein  24.26 
 
 		 443 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4684  lambda family phage portal protein  24.4 
 
 		 500 aa  49.3  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2308  lambda family phage portal protein  21.43 
 
 		 510 aa  49.3  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0803517  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1505  lambda family phage portal protein  20.21 
 
 		 516 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2128  Bacteriophage capsid protein-like protein  21.24 
 
 		 494 aa  45.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0120  phage portal protein, lambda  24.52 
 
 		 281 aa  43.9  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0615825  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>