More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2790 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1644  lytic murein transglycosylase  77.7 
 
 		 407 aa  655    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2958  lytic murein transglycosylase  84.07 
 
 		 408 aa  708    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.141235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2790  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 409 aa  833    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0861684  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2811  lytic murein transglycosylase  79.41 
 
 		 405 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2502  lytic murein transglycosylase  84.31 
 
 		 408 aa  705    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0535188  normal  0.354927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4006  putative membrane-bound lytic transglycosylase precursor protein, putative signal peptide  77.78 
 
 		 406 aa  647    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2304  lytic murein transglycosylase  76.77 
 
 		 407 aa  636    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0222996  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3846  lytic murein transglycosylase  59.52 
 
 		 416 aa  455  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.977376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  42.64 
 
 		 417 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  42.71 
 
 		 419 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  42.12 
 
 		 421 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  41.56 
 
 		 427 aa  259  5.0000000000000005e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4047  lytic murein transglycosylase  41.75 
 
 		 423 aa  259  9e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  39.34 
 
 		 443 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  40.82 
 
 		 429 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  39.56 
 
 		 412 aa  258  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  38.93 
 
 		 412 aa  253  6e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  39.19 
 
 		 451 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  40.05 
 
 		 413 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  38.56 
 
 		 464 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  40.16 
 
 		 413 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  39.43 
 
 		 415 aa  249  5e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  39.28 
 
 		 418 aa  247  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  35.29 
 
 		 409 aa  246  4e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  40.63 
 
 		 438 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0286  lytic murein transglycosylase  37.41 
 
 		 474 aa  246  6.999999999999999e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2246  lytic murein transglycosylase  37.5 
 
 		 490 aa  246  8e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.27518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  38.56 
 
 		 461 aa  245  9e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  40.37 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  40.37 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  38.04 
 
 		 455 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  36.86 
 
 		 398 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0333  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  35.53 
 
 		 418 aa  243  6e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1952  transglycolase  37.53 
 
 		 491 aa  243  6e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  37.67 
 
 		 398 aa  243  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  38.14 
 
 		 464 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  37.75 
 
 		 404 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0070  transglycosylase, putative  38.42 
 
 		 408 aa  242  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18416  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  39.84 
 
 		 438 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  38.4 
 
 		 405 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  39.05 
 
 		 445 aa  239  8e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  37.5 
 
 		 424 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  38.06 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  38.79 
 
 		 445 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  38.24 
 
 		 470 aa  237  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  37.79 
 
 		 469 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  39.79 
 
 		 462 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  38.5 
 
 		 407 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  36.03 
 
 		 398 aa  236  7e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  35.75 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  39.53 
 
 		 413 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  37.37 
 
 		 481 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  38.31 
 
 		 430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  35.86 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  36.22 
 
 		 405 aa  234  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  38.22 
 
 		 454 aa  232  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  39.28 
 
 		 411 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  38.82 
 
 		 417 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  38.62 
 
 		 440 aa  230  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  35.1 
 
 		 448 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  36.27 
 
 		 398 aa  227  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  36.57 
 
 		 419 aa  226  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  36.95 
 
 		 417 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  39.34 
 
 		 400 aa  226  7e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  39.42 
 
 		 429 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  36.36 
 
 		 720 aa  225  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  36.03 
 
 		 398 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  39.84 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3727  lytic murein transglycosylase  34.84 
 
 		 405 aa  224  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  36.95 
 
 		 398 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  36.18 
 
 		 448 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  36.84 
 
 		 401 aa  221  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  37.83 
 
 		 514 aa  220  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  37.57 
 
 		 486 aa  220  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  35.9 
 
 		 439 aa  218  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  37.14 
 
 		 438 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  37.33 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  37.16 
 
 		 398 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  37.8 
 
 		 406 aa  217  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  38.26 
 
 		 470 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  34.07 
 
 		 422 aa  216  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  36.98 
 
 		 430 aa  216  7e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  37.02 
 
 		 400 aa  215  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  38.86 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0167  lytic murein transglycosylase  37.74 
 
 		 445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000010193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  36.6 
 
 		 425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  38.17 
 
 		 393 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  35.45 
 
 		 435 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  33.16 
 
 		 395 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1375  lytic murein transglycosylase  34.36 
 
 		 412 aa  212  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  38.22 
 
 		 474 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  34.29 
 
 		 438 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  34.57 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  34.29 
 
 		 411 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  34.29 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  37.9 
 
 		 393 aa  210  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  34.14 
 
 		 377 aa  209  6e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2243  hypothetical protein  33.59 
 
 		 412 aa  209  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  34.65 
 
 		 430 aa  209  7e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  33.25 
 
 		 424 aa  209  8e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>