More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4006 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1644  lytic murein transglycosylase  79.66 
 
 		 407 aa  673    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2958  lytic murein transglycosylase  80.05 
 
 		 408 aa  667    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.141235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2811  lytic murein transglycosylase  77.59 
 
 		 405 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4006  putative membrane-bound lytic transglycosylase precursor protein, putative signal peptide  100 
 
 		 406 aa  827    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2502  lytic murein transglycosylase  79.22 
 
 		 408 aa  659    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0535188  normal  0.354927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2790  lytic murein transglycosylase  77.97 
 
 		 409 aa  647    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0861684  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2304  lytic murein transglycosylase  79.68 
 
 		 407 aa  641    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0222996  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3846  lytic murein transglycosylase  59.09 
 
 		 416 aa  463  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.977376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  44.01 
 
 		 417 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  43.75 
 
 		 419 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  43.49 
 
 		 421 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  42.63 
 
 		 429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  41.94 
 
 		 427 aa  260  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  41.19 
 
 		 415 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4047  lytic murein transglycosylase  42.35 
 
 		 423 aa  259  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  40.79 
 
 		 418 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  40.52 
 
 		 413 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  40.52 
 
 		 413 aa  257  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  39.24 
 
 		 443 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  39.49 
 
 		 464 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  38.36 
 
 		 398 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 464 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  38.36 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 461 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  36.79 
 
 		 409 aa  249  8e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  41.11 
 
 		 405 aa  249  9e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  38.29 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  39.19 
 
 		 412 aa  245  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  39.37 
 
 		 455 aa  244  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  40.37 
 
 		 438 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0286  lytic murein transglycosylase  38.13 
 
 		 474 aa  243  3e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2246  lytic murein transglycosylase  37.22 
 
 		 490 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.27518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  40.21 
 
 		 438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  37.98 
 
 		 424 aa  243  5e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  40.11 
 
 		 438 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  39.38 
 
 		 430 aa  243  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  38.33 
 
 		 398 aa  242  7e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  40.11 
 
 		 438 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  39.34 
 
 		 469 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  37.9 
 
 		 412 aa  242  7.999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1952  transglycolase  37.17 
 
 		 491 aa  241  1e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  39.34 
 
 		 470 aa  241  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  40.37 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  39.69 
 
 		 462 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  38.68 
 
 		 445 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  38.68 
 
 		 445 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  38.86 
 
 		 411 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  37.23 
 
 		 407 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  39.43 
 
 		 413 aa  239  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  38.84 
 
 		 481 aa  238  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  36.98 
 
 		 407 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  39.63 
 
 		 419 aa  237  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  36.14 
 
 		 486 aa  237  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  38 
 
 		 440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  39.58 
 
 		 514 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  37.05 
 
 		 448 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  39.27 
 
 		 454 aa  233  6e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  37.1 
 
 		 405 aa  232  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0070  transglycosylase, putative  37.41 
 
 		 408 aa  232  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18416  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3727  lytic murein transglycosylase  38.32 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  40.72 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  38.52 
 
 		 407 aa  230  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  37.16 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  39.7 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0333  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  35.62 
 
 		 418 aa  227  2e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  40.69 
 
 		 418 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  37.41 
 
 		 398 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  38.5 
 
 		 398 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  37.05 
 
 		 720 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  36.8 
 
 		 439 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  37.77 
 
 		 417 aa  223  4e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  36.8 
 
 		 401 aa  223  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  37.89 
 
 		 430 aa  223  6e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  36.27 
 
 		 422 aa  222  7e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  38.94 
 
 		 400 aa  222  8e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  38.3 
 
 		 417 aa  222  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  37.14 
 
 		 448 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  38.06 
 
 		 406 aa  222  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0691  membrane-bound lytic murein transglycosylase  35.78 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000567211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  36.88 
 
 		 396 aa  219  7e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0167  lytic murein transglycosylase  37.57 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000010193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  35.68 
 
 		 411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  35.52 
 
 		 438 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  35.52 
 
 		 436 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  38.22 
 
 		 400 aa  216  8e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  35.26 
 
 		 438 aa  215  9e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  36.97 
 
 		 438 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2243  hypothetical protein  34.48 
 
 		 412 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  37.75 
 
 		 395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  37.66 
 
 		 434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1375  lytic murein transglycosylase  35.11 
 
 		 412 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  33.85 
 
 		 395 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0662  lytic murein transglycosylase  35.14 
 
 		 433 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00608172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  35.73 
 
 		 377 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  38.34 
 
 		 393 aa  213  7e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  34.91 
 
 		 430 aa  212  9e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  36.34 
 
 		 425 aa  212  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  35.17 
 
 		 424 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  36.91 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>