36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2746 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 483 aa  999    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.722344  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0140  hypothetical protein  49.26 
 
 		 481 aa  472  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2095  hypothetical protein  36.8 
 
 		 192 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0720  hypothetical protein  34.75 
 
 		 135 aa  77  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.125805 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3085  response regulator receiver domain-containing protein  34.09 
 
 		 159 aa  75.1  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3524  hypothetical protein  41.32 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0431  hypothetical protein  41.32 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2501  hypothetical protein  30.65 
 
 		 139 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402413  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3702  hypothetical protein  40.5 
 
 		 195 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0460  hypothetical protein  39.17 
 
 		 181 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0674  hypothetical protein  37.9 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0526  hypothetical protein  38.66 
 
 		 195 aa  66.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07420  hypothetical protein  36.29 
 
 		 204 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.360329 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0934  hypothetical protein  29.03 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.185981  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.15 
 
 		 1343 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1094 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1224 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  28.85 
 
 		 958 aa  52  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.9 
 
 		 524 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.35 
 
 		 510 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  38.46 
 
 		 431 aa  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0870  hypothetical protein  33.71 
 
 		 351 aa  49.3  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  29.33 
 
 		 546 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.92 
 
 		 831 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1816  hypothetical protein  29.31 
 
 		 204 aa  47.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308354  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.62 
 
 		 1139 aa  47.4  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3319  SH3 type 3 domain-containing protein  21.29 
 
 		 321 aa  46.6  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.85 
 
 		 370 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.73 
 
 		 667 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2426  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  41.07 
 
 		 464 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.31 
 
 		 180 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1905  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.36 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.05 
 
 		 1412 aa  43.9  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0515  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  40.3 
 
 		 170 aa  43.5  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1507  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  41.07 
 
 		 445 aa  43.5  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  31.93 
 
 		 1148 aa  43.5  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>