139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1934 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1788  SH3 type 3 domain-containing protein  100 
 
 		 158 aa  315  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.292681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1934  SH3 type 3 domain protein  100 
 
 		 158 aa  315  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.890926  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3295  hypothetical protein  73.28 
 
 		 158 aa  199  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3400  protein of unknown function DUF1058  45.45 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0346  hypothetical protein  29.25 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00234847  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2188  hypothetical protein  34.15 
 
 		 197 aa  63.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1125  hypothetical protein  26.9 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2312  hypothetical protein  34.15 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2184  hypothetical protein  28.89 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0986  hypothetical protein  34.15 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1509  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.16 
 
 		 751 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0136849  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0315  hypothetical protein  32.82 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3942  hypothetical protein  29.59 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0692  enterotoxin/cell wall-binding protein  28.68 
 
 		 410 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0959  enterotoxin  30.51 
 
 		 426 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0044  hypothetical protein  27.78 
 
 		 185 aa  57.4  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0258  hypothetical protein  28.93 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0036  hypothetical protein  28.05 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1942  hypothetical protein  32.52 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398084  decreased coverage  0.00719314 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4408  protein of unknown function DUF1058  31.47 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4088  protein of unknown function DUF1058  32.14 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0615  hypothetical protein  28.47 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.190546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0072  hypothetical protein  30.71 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237291  normal  0.464662 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0706  enterotoxin/cell wall-binding protein  27.94 
 
 		 414 aa  55.1  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  29.38 
 
 		 391 aa  55.1  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0887  hypothetical protein  29.66 
 
 		 420 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0757  hypothetical protein  29.66 
 
 		 386 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0796  hypothetical protein  29.66 
 
 		 386 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0891  enterotoxin  29.66 
 
 		 410 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46371e-34 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3642  hypothetical protein  28.12 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000544722 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4487  enterotoxin  26.24 
 
 		 469 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113564 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3412  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.71 
 
 		 310 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000169904  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2486  protein of unknown function DUF1058  30.6 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3789  hypothetical protein  25.76 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0427  protein of unknown function DUF1058  30.26 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0218  hypothetical protein  28.47 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.0484329 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.76 
 
 		 616 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1540  protein of unknown function DUF1058  28.39 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0849  enterotoxin  27.21 
 
 		 422 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  26.67 
 
 		 556 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0510  hypothetical protein  29.71 
 
 		 192 aa  52  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.833855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.25 
 
 		 907 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3379  hypothetical protein  25.9 
 
 		 183 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0614  hypothetical protein  28.78 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  23.26 
 
 		 424 aa  50.8  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0462  SH3 type 3 domain-containing protein  30.15 
 
 		 1751 aa  50.8  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.5468 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01485  peptidase  31.67 
 
 		 377 aa  50.4  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0479  hypothetical protein  29.27 
 
 		 200 aa  50.4  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.88 
 
 		 476 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0379  protein of unknown function DUF1058  30 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0477  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.45 
 
 		 377 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2971  hypothetical protein  27.64 
 
 		 204 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  42.37 
 
 		 625 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0353  hypothetical protein  28.47 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0707  3D domain-containing protein  27.66 
 
 		 478 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3815  hypothetical protein  28.06 
 
 		 316 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3743  hypothetical protein  28.06 
 
 		 310 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00197762  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  26.59 
 
 		 536 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3490  prophage LambdaBa01, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family protein 2  23.56 
 
 		 310 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000347114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3767  prophage lambdaba01, n-acetylmuramoyl-l-alanine amidase family protein 2  23.56 
 
 		 310 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000174527  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5033  3D domain-containing protein  27.12 
 
 		 292 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3766  hypothetical protein  28.06 
 
 		 310 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000229315  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1266  hypothetical protein  27.01 
 
 		 185 aa  48.5  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5592  hypothetical protein  27.97 
 
 		 292 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165295 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3475  enterotoxin/cell wall-binding protein  27.66 
 
 		 311 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0617059  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4125  hypothetical protein  26.87 
 
 		 183 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5059  hypothetical protein  28.47 
 
 		 182 aa  48.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5364  hypothetical protein  27.97 
 
 		 292 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0610  peptidase M23B  27.91 
 
 		 383 aa  47.8  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000136568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3562  hypothetical protein  28.06 
 
 		 310 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0820775  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3845  hypothetical protein  28.06 
 
 		 310 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00016497  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5957  protein of unknown function DUF1058  29.13 
 
 		 184 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0475342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5853  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.88 
 
 		 311 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3461  enterotoxin/cell-wall binding protein  28.06 
 
 		 310 aa  47.4  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000115171  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3725  hypothetical protein  28.06 
 
 		 310 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9172500000000004e-32 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1487  hypothetical protein  28.57 
 
 		 310 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000144613  hitchhiker  0.00534322 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1100  hypothetical protein  29.14 
 
 		 239 aa  47.4  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00740954  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0735  hypothetical protein  25.55 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2684  prophage LambdaBa01, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 2  26.22 
 
 		 311 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2687  hypothetical protein  29.53 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  21.71 
 
 		 564 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  21.71 
 
 		 564 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  22.48 
 
 		 564 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  21.71 
 
 		 564 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  21.71 
 
 		 564 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5360  hypothetical protein  25.2 
 
 		 338 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0455  protein of unknown function DUF1058  28.26 
 
 		 197 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3345  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.37 
 
 		 448 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4935  enterotoxin/cell wall-binding protein  25.2 
 
 		 294 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0422  hypothetical protein  28.26 
 
 		 197 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.26681 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.27 
 
 		 1776 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0492  protein of unknown function DUF1058  30.84 
 
 		 197 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5090  hypothetical protein  25.42 
 
 		 290 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5481  hypothetical protein  25.42 
 
 		 290 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  23.4 
 
 		 773 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2756  hypothetical protein  28.26 
 
 		 440 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00725843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5330  hypothetical protein  25.42 
 
 		 290 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3987700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2967  hypothetical protein  28.26 
 
 		 440 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000478189  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2231  hypothetical protein  36.84 
 
 		 194 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115294 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5412  hypothetical protein  25.42 
 
 		 290 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>